Summary

化学物質安全性のスクリーニングおよびシステム生物学データの生成のために発生毒性アッセイベースのヒト多能性幹細胞

Published: June 17, 2015
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Summary

プロトコルは、ヒト胚性幹細胞およびトランスクリプトーム研究に基づいて、2つのin vitro発生毒性試験システム(UKKとUKN1)を記述します。試験系は、ヒトの発生毒性の危険性を予測し、動物実験、コストおよび化学安全性試験のために必要な時間を短縮するために寄与することができます。

Abstract

-omics技術と組み合わせて、様々な組織にヒト多能性幹細胞を区別するための効率的なプロトコルは、潜在的な薬剤のインビトロ毒性試験のための新しい展望を開きます。このようなアッセイのための強固な科学的基礎を提供するためには、開発の時間経過にとシステム生物学のアプローチにより、基礎となる調節機構の定量的な情報を得ることが重要となります。 2つのアッセイは、したがって、これらの要件のためにここに調整されています。 UKK試験システムでは、ヒト胚性幹細胞(hESCの)(または他の多能性細胞)が自然にすべての3つの胚葉の細胞の生成を可能にするために、胚様体における14日間分化するように残されます。このシステムは、初期ヒト胚発生の重要なステップを再現すると、細胞が分化の間の化学物質にさらされている場合には、ヒト特異的な初期胚毒性/催奇形性を予測することができます。 UKN1試験システムはpopulatに分化するヒトES細胞に基づいています6日間の神経外胚葉前駆(NEP)は、細胞のイオン。このシステムは、初期の神経発達を再現すると、初期の発達神経毒性と化学物質によって引き起こさエピジェネティックな変化を予測します。両方のシステムは、トランスクリプトームのマイクロアレイ研究と組み合わせて、毒性のバイオマーカーを同定するのに適しています。さらに、それらはシステム生物学の分析のための入力データを生成するために組み合わせて使用​​することができます。これらの試験系は、動物を大量に必要とする伝統的な毒性試験を超える利点を有します。試験システムは、薬物開発及び化学物質安全性評価のためのコストの低減に寄与し得ます。それらの組み合わせは、特に具体的に神経発達に影響を与える可能性がある化合物に光を投げかけて。

Introduction

細胞の様々なタイプに分化するヒト胚性幹細胞(hESCの)の能力は、in vitro毒性試験1、疾患のモデリングおよび再生医療2の新時代を開きました。幹細胞はそれらの多能性状態を維持するために、および特殊化した細胞3,4に分化するように、自己複製する能力に恵まれています。ヒトES細胞(全ての主要な細胞型に分化する能力)の特性はまた、核移植5によって生成されたヒト誘導多能性幹細胞(hiPSC)または細胞などの他のヒト多能性幹細胞に見出されます。例えば、多くの異なるhESC株は、ニューロン6、腎細胞7、神経堤細胞8、心筋9-12、またはセル13,14のような肝細胞に分化されています。また、ヒトES細胞は自発的に胚様体(EB)19,20内のすべての3つの胚葉15-18の細胞に分化することができます。 Eアーリー胚発生は、マイクロアレイ技術15を用いてトランスクリプトによってmRNAレベルで捕捉された異なる胚葉に関連する種々の遺伝子の差次的発現により調節されます。これらの努力は、ヒトES細胞/ hiPSCとトランスクリプトーム解析(レビューのために21,22を参照)に基づいて、器官特異的毒性学的モデルの確立をもたらしました。実験動物を用いた前臨床研究は、常に人間の安全性の予測ではないように、これらのモデルは、毒性学的研究のための実験動物の伝統的な使用上の利点を有しています。患者に遭遇する薬剤誘発される毒性は、多くの場合、ヒトと実験動物の間で異なる代謝またはシグナル伝達プロセスに関連しています。種の違いは、ヒトにおける発生毒性の信頼性の早期検出を防止していて、例えば、そのようなサリドマイド23,24およびジエチル25,26のような薬剤は、催奇形性のために市場から撤退しました。ターリーdomideは、ラットまたはマウスのいずれかの発生毒性を示されていません。例えば、メチル水銀27などの環境化学物質は、種々の種における神経系に対する出生前発生毒性をもたらしたが、人間の症状は動物でモデル化することは困難でした。種特異性の問題の問題に対処するために、別のプロジェクトの下で働く科学者などに疑われる人の毒物を使用して、胚毒性、神経毒性、心毒性、肝毒性および腎毒性のために、異なるモデルの開発に従事している再保護、ESNATS、探偵のような幹細胞に基づきます人間に影響を与えます。欧州コンソーシアムプロジェクト「胚性幹細胞ベースの新しい代替試験戦略(ESNATS)」の下では5個の試験システムが確立されています。一つの試験システム、いわゆるUKK(UniversitätsK linikum K OLN)テストシステムは、部分的に初期ヒト胚発生をキャプチャします。このS INystemヒト胚性H9細胞は、15および胚葉特定の署名がアフィメトリクスマイクロアレイプラットフォームを使用して、トランスクリプトミクスプロファイルによって撮影された三胚葉(外胚葉、内胚葉および中胚葉)に区別されます。サリドマイド28、バルプロ酸、メチル水銀16,17、またはシトシンアラビノシド15のような種々の発生毒性物質は、このシステムで試験されている、及び毒物特定の遺伝子シグネチャーが得られました。第二の試験システムでは、そのように検査システム1 UKN1(K onsta N Z のU niversity)と呼ばれる、H9細胞を6日間神経外胚葉前駆細胞(NEP)に区別されます。これは、PAX6OTX2などの神経遺伝子マーカーの高発現によって証明されている。6日間分化の間に、NEP細胞は、VPA、メチル水銀などの発達神経毒性物質にさらされています。毒物固有の脱規制トランスクリプトミクスプロファイルはobtaiされていますアフィメトリクスマイクロアレイプラットフォーム16,29を用いて、同様に定義さ。

21 世紀の毒物学のための新しいビジョンは、テスト·システムにのみ、長期的な毒物のインキュベーションの最後に、in vivoで組織病 ​​理学、またはトランスクリプトームの変化のような表現型の説明が得られていないことを想定しています。むしろアッセイは機構的情報3、およびこの情報は危険な影響30のための科学的根拠を提供し、いわゆる有害転帰の経路(AOP)にマッピングすることができることを提供することを示唆しています。このような情報を提供するために、適用されるテストシステムは非常に質が強固な標準操作手順によって文書として例えば、31を制御する必要があります。また、時間依存性の変化は、高分解能でマッピングされる必要があります。これは、同期の変化32とテストシステムを必要とします。ここで説明UKN1とUKKテストシステムは、これらの要件のために最適化されています。

Protocol

以下のプロトコルは、ヒト胚幹細胞株(hESCの)H9を用いて行きました。この細胞株は、日常のhESC培養培地中の有糸分裂不活性化されたマウス胚繊維芽細胞(MEF)のbFGFを補充したMEFを取り除くために、このようなマトリゲルとして基底膜マトリックスでコーティングされた6センチメートルペトリ皿上の幹細胞培地で培養上で培養しました。 > 80%コンフルエントなプレ?…

Representative Results

UKKテストシステム中のメチル水銀暴露細胞毒性アッセイは、メチル水銀の毒性( 図1)のためのIC 10値(10%生存性の減少)を得るH9のEBを用いて行きました。また、ベースのマイクロアレイ(Affymetrix社のプラットフォーム)バイオマーカーの研究を行いました。 H9 EBは14日間メチル水銀(0.25および1μM)に暴露されました。 14日目に、試料は、トリゾ?…

Discussion

毒性試験への従来のアプローチは、このように試験が高コストと時間のかかる大規模な製造動物実験を伴います。また、種間の差異に起因する前臨床動物安全性試験は、ヒトに関連可能性のある薬剤の毒性効果を予測することは必ずしも有効ではありません。ヒト以外の霊長類は、最も予測可能であるが、まだ強い倫理的、および社会経済的需要が急速に生体外試験高感度か?…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

References

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Citer Cet Article
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

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