Summary

Umano cellule staminali pluripotenti Basato Tossicità per lo sviluppo saggi per Chemical Screening e Safety Systems Biology generazione dati

Published: June 17, 2015
doi:

Summary

I protocolli descrivono due sistemi di test in vitro di tossicità dello sviluppo (UKK e UKN1) a base di cellule staminali embrionali umane e studi trascrittoma. I sistemi di test prevedono pericolo tossicità per lo sviluppo umano, e possono contribuire a ridurre studi sugli animali, i costi e il tempo necessario per le prove della sicurezza chimica.

Abstract

Protocolli efficaci per differenziare le cellule staminali pluripotenti umane a vari tessuti in combinazione con le tecnologie omiche aprono nuovi orizzonti per la tossicità in vitro test de di potenziali farmaci. Per fornire una solida base scientifica per tali dosaggi, sarà importante per ottenere informazioni quantitative sul corso tempo di sviluppo e sui sottostanti meccanismi regolatori di approcci biologia dei sistemi. Due saggi sono stati quindi sintonizzati qui per queste esigenze. Nel sistema di test UKK, cellule staminali embrionali umane (hESC) (o altre cellule pluripotenti) sono lasciate per differenziare spontaneamente per 14 giorni in corpi embrionali, a consentire la generazione di cellule di tutte e tre strati germinali. Questo sistema ricapitola passaggi chiave del primo sviluppo embrionale umano, ed è in grado di prevedere in anticipo embrionale tossicità / teratogenicità specifici umano, se le cellule sono esposti a sostanze chimiche durante la differenziazione. Il sistema di test UKN1 si basa sulla differenziazione hESC a un populationi di neuroectodermica progenitore (NEP), le cellule per 6 giorni. Questo sistema ricapitola precoce sviluppo neurale e prevede presto neurotossicità per lo sviluppo e cambiamenti epigenetici innescati da sostanze chimiche. Entrambi i sistemi, in combinazione con studi transcriptome microarray, sono adatti per l'identificazione di marcatori di tossicità. Inoltre, essi possono essere usati in combinazione per generare dati di input per l'analisi dei sistemi biologia. Questi sistemi di prova hanno vantaggi rispetto ai tradizionali studi tossicologici che richiedono grandi quantità di animali. I sistemi di test, possono contribuire ad una riduzione dei costi per lo sviluppo di farmaci e la valutazione della sicurezza chimica. La loro combinazione mette in luce soprattutto sui composti che possono influenzare lo sviluppo neurologico specifico.

Introduction

La capacità delle cellule staminali embrionali umane (hESC) di differenziarsi in vari tipi di cellule ha aperto una nuova era di tossicità test in vitro 1, modelli di malattia e della medicina rigenerativa 2. Le cellule staminali sono dotati della capacità di auto-replicarsi, per mantenere il loro stato pluripotente, e di differenziarsi in cellule specializzate 3,4. Le proprietà di hESC (capacità di differenziarsi a tutti i principali tipi di cellule) si trovano anche in altre cellule staminali pluripotenti umane, come le cellule umane pluripotenti indotte staminali (hiPSC) o le cellule generate da trasferimento nucleare 5. Per esempio, molte linee di hESC diverse sono state differenziate in neuroni 6, cellule renali 7, cellule della cresta neurale 8, cardiomiociti 9-12 o epatociti come le cellule 13,14. Inoltre, hESC può differenziarsi spontaneamente in cellule di tutti e tre i foglietti embrionali 15-18 a corpi embrionali (EBS) 19,20. Esviluppo embrionale arly è regolato da espressione differenziale dei vari geni correlati ai diversi foglietti embrionali che è stato catturato a livello di mRNA da trascrittomica che usano la tecnologia microarray 15. Questi sforzi hanno portato alla definizione di modelli tossicologici specifici di organi sulla base di hESC / hiPSC e trascrittomica analisi (per la revisione cfr 21,22). Questi modelli hanno vantaggi rispetto al tradizionale uso di animali da laboratorio per gli studi tossicologici, come studi preclinici utilizzano animali da laboratorio non sono sempre predittivi della sicurezza umana. La tossicità indotti dagli stupefacenti riscontrati nei pazienti sono spesso legati a processi metabolici o di segnalazione che si differenziano tra esseri umani e animali da esperimento. La differenza di specie ha impedito l'affidabile la diagnosi precoce di tossicità sullo sviluppo umano, e per esempio farmaci come talidomide 23,24 e dietilstilbestrolo 25,26 sono stati ritirati dal mercato a causa di teratogenicità. ThaliDomide non ha mostrato alcuna tossicità sullo sviluppo nei ratti o topi. Sostanze chimiche ambientali come il mercurio metilico 27 provocato tossicità per lo sviluppo prenatale rispetto al sistema nervoso in varie specie, ma manifestazioni umane sono state difficili da modellare negli animali. Per affrontare il problema dei problemi specie specificità, gli scienziati che lavorano sotto diversi progetti basati sulle cellule staminali come ReProTect, ESNATS, DETECTIVE ecc sono impegnati nello sviluppo di modelli diversi per la tossicità embrionale, neurotossicità, cardiotossicità, epatotossicità e nefrotossicità con sostanze tossiche umani sospettati di interessare l'uomo. Nell'ambito del progetto europeo consorzio 'embrionali Novel strategie di sperimentazione alternative a base di cellule staminali (ESNATS)' sono stati stabiliti cinque sistemi di test. Un sistema di prova il cosiddetto UKK (niversitäts k linikum K OLN U) sistema di test acquisisce parzialmente primi stadi dello sviluppo dell'embrione umano. In questo sistema cellule H9 embrionali umane sono differenziati in tre foglietti embrionali (ectoderma, endoderma e mesoderma) 15 e foglietto embrionale firme specifici sono stati catturati da trascrittomica profilo utilizzando la piattaforma microarray Affymetrix. Varie sostanze tossiche sviluppo come talidomide 28, acido valproico, metilmercurio 16,17, o citosina arabinoside 15 sono stati testati in questo sistema, e la tossicità specifica firme genici sono stati ottenuti. In un secondo sistema di test, il cosiddetto la (U niversità di K onsta n z) UKN1 sistema di prova 1, cellule H9 sono differenziate alle cellule progenitrici neuroectodermal (NEP) per 6 giorni. Ciò è dimostrato da elevata espressione di marcatori genici neurale come PAX6 e OTX2. Durante la differenziazione per 6 giorni, le cellule NEP sono state esposte a sviluppo neuro-tossici come il VPA, il mercurio metilico. Tossico-specifici profili de-regolato trascrittomica sono stati ottenudefinita come pure utilizzando la piattaforma microarray Affymetrix 16,29.

La nuova visione per la tossicologia del 21 ° secolo, prevede che i sistemi di test non producono non solo descrizioni fenotipiche come istopatologia in vivo, o cambiamenti trascrittoma alla fine di incubazione la tossicità a lungo termine. Suggerisce piuttosto che le analisi forniscono informazioni relative alla meccanica 3, e che tali informazioni possono essere mappati ai cosiddetti percorsi di outcome avversi (AOP), che forniscono un razionale scientifico per gli effetti pericolosi 30. Per fornire tali informazioni, i sistemi di test applicati devono essere altamente qualità controllata 31, come ad esempio documentato da solide procedure operative standard. Inoltre, variazioni dipendenti dal tempo devono essere mappati con alta risoluzione. Ciò richiede sistemi di test con variazioni sincronizzate 32. I sistemi di test UKN1 e UKK qui descritti sono stati ottimizzati per queste esigenze.

Protocol

Il seguente protocollo è stato eseguito utilizzando la linea di cellule staminali embrionali umane (hESC) H9. Questa linea cellulare è stata regolarmente coltivati ​​su fibroblasti di topo mitoticamente inattivato embrionali (MEF) in coltura hESC multimediale integrato con bFGF e poi coltivate in mezzi di cellule staminali su 6 centimetri piastre Petri rivestite di matrice membrana basale come matrigel, per sbarazzarsi di MEF. Le cellule H9 di> 80% lastre confluenti sono stati utiliz…

Representative Results

Esposizione al mercurio metile in sistema di prova UKK Il saggio di citotossicità è stata eseguita con H9 EBs per ottenere un valore di IC 10 (riduzione della vitalità del 10%) per la citotossicità di metilmercurio (Figura 1). Abbiamo anche eseguito un microarray basato (piattaforma Affymetrix) studio biomarker. La H9 EBs sono stati esposti al mercurio metilico (0.25 e 1 micron) per 14 giorni. Il giorno 14, i campioni sono stati raccolti utilizzando TRIzol e R…

Discussion

Gli approcci tradizionali alla sperimentazione tossicologica coinvolgono ampi studi su animali rendendo così i test costoso e richiede tempo. Inoltre, a causa delle differenze interspecie gli studi sulla sicurezza animale preclinici non sono sempre validi per prevedere effetti di tossicità di potenziali farmaci rilevanti per gli esseri umani. Anche se i primati non umani sono più prevedibili, ancora forte etica, e le richieste socioeconomiche sono rapidamente alzando dalla società moderne per sviluppare sensibili e …

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

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Citer Cet Article
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

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