Summary

Menschliche pluripotente Stammzelle Basierend Entwicklungstoxizität Assays für chemische Sicherheit Screening und Systembiologie Datengenerierung

Published: June 17, 2015
doi:

Summary

Die Protokolle beschreiben zwei In-vitro-Testsysteme Entwicklungstoxizität (UKK und UKN1) auf der Grundlage humaner embryonaler Stammzellen und Transkriptom-Studien. Die Testsysteme voraussagen menschlichen Entwicklungstoxizität Gefahren und kann dazu beitragen, Tierversuche, die Kosten und die Zeit für die Stoffsicherheitstests zu reduzieren.

Abstract

Effiziente Protokolle für die menschliche pluripotente Stammzellen zu verschiedenen Geweben in Kombination mit differen -omics Technologien eröffnet neue Horizonte für in-vitro-Toxizitätsprüfung von potentiellen Medikamenten. Um eine solide wissenschaftliche Grundlage für solche Tests liefern, wird es wichtig sein, um quantitative Informationen über den zeitlichen Verlauf der Entwicklung und auf die zugrunde liegenden Regulationsmechanismen durch die Systembiologie zu gewinnen. Zwei Tests wurden daher hier für diese Anforderungen abgestimmt. In der UKK-Test-System werden menschliche embryonale Stammzellen (hESC) (oder anderen pluripotenten Zellen) links nach spontan differenzieren für 14 Tage in embryonale Körper, um die Erzeugung von Zellen aller drei Keimblätter zu ermöglichen. Dieses System rekapituliert Schlüsselschritte der frühen embryonalen Entwicklung, und es kann humanspezifischen frühen embryonalen Schädigung / Teratogenität vorherzusagen, wenn Zellen auf Chemikalien während der Differenzierung ausgesetzt. Die UKN1 Testsystem basiert auf hES bezogen auf einen Differen populatIonen neuroektodermalen Vorläufer (NEP) Zellen für 6 Tage. Dieses System rekapituliert frühen neuronalen Entwicklung und prognostiziert frühen Entwicklungsneurotoxizität und epigenetische Veränderungen durch Chemikalien ausgelöst. Beide Systeme in Kombination mit Transkriptom Mikroarray Studien eignen sich zur Identifizierung von Biomarkern Toxizität. Darüber hinaus können sie in Kombination verwendet, um Daten für die Systembiologie Analyse zu erzeugen. Diese Testsysteme haben Vorteile gegenüber den traditionellen toxikologische Untersuchungen, die große Mengen an Tieren. Die Testsysteme können zu einer Verringerung der Kosten für die Wirkstoffentwicklung und chemische Sicherheitsbewertung beitragen. Ihre Kombination beleuchtet vor allem auf Verbindungen, die Entwicklung des Nervensystems gezielt beeinflussen können.

Introduction

Die Fähigkeit von menschlichen embryonalen Stammzellen (hESC) in verschiedenen Zelltypen zu differenzieren, eine neue Ära der In-vitro-Toxizitätstests 1, Krankheitsmodelle und der regenerativen Medizin 2 eröffnet. Die Stammzellen werden mit der Fähigkeit, selbst zu replizieren, um ihre pluripotenten Zustand zu halten und sich in spezialisierte Zellen 3,4 unterscheiden dotiert. Die Eigenschaften der hESC (Fähigkeit, zu allen wichtigen Zelltypen differenzieren) werden auch in anderen menschlichen pluripotenten Stammzellen, wie Menschen induzierte pluripotente Stammzellen (hiPSC) oder Zellen, die durch Kerntransfer erzeugt 5 gefunden. Zum Beispiel haben viele verschiedene Linien hESC in Neuronen 6, Nierenzellen 7, Neuralleistenzellen 8, Kardiomyozyten 9-12 oder Leberzellen wie Zellen 13,14 differenziert. Darüber hinaus kann hESC spontan in Zellen aller drei Keimblätter 15-18 in Embryoidkörpern (EBS) 19,20 unterscheiden. Early embryonalen Entwicklung durch unterschiedliche Expression verschiedener Gene zu den verschiedenen Keimblätter, die auf mRNA-Ebene durch Transkriptomik mit Microarray-Technologie 15 aufgenommen wurde, im Zusammenhang geregelt. Diese Bemühungen führten zu der Gründung der Organspezifische toxikologische Modelle auf Basis von hESC / hiPSC und Transkriptom-Analyse (für einen Überblick siehe 21,22). Diese Modelle haben Vorteile gegenüber der traditionellen Verwendung von Versuchstieren für toxikologische Untersuchungen, wie präklinische Studien mit Labortieren sind nicht immer prädiktiv für die Sicherheit der Menschen. Das Medikament induzierte Toxizitäten bei Patienten angetroffen werden oft metabolische oder Signalprozesse, die zwischen Menschen und Versuchstieren unterscheiden verwandt. Die Spezies Unterschied hat die zuverlässige Früherkennung von Entwicklungstoxizität beim Menschen verhindert und zum Beispiel Arzneimittel, wie Thalidomid 23,24 und 25,26 Diethylstilbestrol wurden aus dem Markt aufgrund Teratogenität zurückgezogen. ThaliDomide hat keine Entwicklungstoxizität bei Ratten und Mäusen gezeigt. Umweltchemikalien wie Methylquecksilber 27 resultierte in der pränatalen Entwicklungstoxizität in Bezug auf das Nervensystem in verschiedenen Arten, aber menschlichen Erscheinungsformen sind schwer zu in Tiere. Um das Problem der Spezies-Spezifität Probleme anzugehen, Wissenschaftler, die im Rahmen verschiedener Projekte auf Basis von Stammzellen wie ReProTect, ESNATS, Detektiv etc. sind in die Entwicklung der verschiedenen Modelle für embryonale Toxizität, Neurotoxizität, Kardiotoxizität, Lebertoxizität und Nephrotoxizität mit menschlichen Giftstoffe zu vermuten engagiert Auswirkungen auf den Menschen. Im Rahmen des europäischen Konsortiums Projekt "embryonalen Stammzellen-basierten Roman alternativer Test (ESNATS)" fünf Testsysteme wurden eingerichtet. Ein Testsystem die sogenannte UKK (U niversitäts k linikum K ÖLN) Testsystem zum Teil erfasst frühen embryonalen Entwicklung. In diesem system menschlichen embryonalen H9-Zellen werden in drei Keimblätter (Ektoderm, Entoderm und Mesoderm) 15 und Keim spezifischen Signaturen von Transkriptomik gefangen genommen worden Profile mit Hilfe der Affymetrix-Microarray-Plattform unterschieden. Verschiedenen Entwicklungsgiftstoffen wie Thalidomid 28, Valproinsäure, Methylquecksilber 16,17 oder Cytosinarabinosid 15 haben in diesem System getestet und Giftstoff spezifische Gen-Signaturen erhalten wurden. In einem zweiten Testsystem, das so genannte UKN1 (U NIVERSITÄT K onsta n z) Testsystem 1 werden H9-Zellen zu neuroektodermalen Progenitorzellen (NEP) für 6 Tage differenziert. Dies wird durch eine hohe Expression der neuronalen Marker-Gen wie PAX6 und OTX2 belegt. Während der Differenzierung für 6 Tage wurden NEP-Zellen zu Entwicklungsneurotoxisch, wie VPA, Methylquecksilber ausgesetzt. Giftstoff spezifische deregulierten Transkriptomik Profile wurden obtainiert als auch mit Hilfe der Affymetrix-Microarray-Plattform 16,29.

Die neue Vision für die Toxikologie des 21. Jahrhunderts sieht vor, dass Testsysteme nicht nur zu erhalten phänotypische Beschreibungen wie Histopathologie in vivo oder Transkriptom Änderungen am Ende des langfristigen Giftstoff Inkubationen. Vielmehr legt nahe, dass Assays stellen mechanistische Informationen 3, und dass diese Informationen, so genannte abgebildet werden negative Ergebnis Wegen (AOP), die eine wissenschaftliche Begründung für den Ex-Effekte 30 bereitzustellen. Um solche Informationen zu liefern, haben die zur Prüfung verwendeten Systeme werden in hohem Grade Qualität kontrolliert 31, wie beispielsweise durch robuste Standardarbeitsanweisungen dokumentiert. Darüber hinaus müssen die zeitabhängigen Änderungen mit hoher Auflösung abgebildet werden. Dies erfordert Testsysteme mit synchronisierten Änderungen 32. Die hier beschriebenen UKN1 und UKK-Test-Systeme für diese Anforderungen optimiert.

Protocol

Das folgende Protokoll wurde unter Verwendung von humanen embryonalen Stammzelllinie (hESC) H9. Diese Zelllinie wurde routinemäßig auf mitotisch inaktivierten embryonalen Maus-Fibroblasten (MEFs) in hESC Kulturmedien mit bFGF ergänzt und anschließend in der Stammzell Medien kultiviert auf 6 cm Petrischalen mit Basalmembranmatrix beschichtet wie Matrigel, um von MEFs loszuwerden kultiviert. Die H9-Zellen von> 80% konfluente Platten wurden für weitere Passage verwendet. H9-Zellen auf Ba…

Representative Results

Methylquecksilberbelastung in UKK Testsystem Zytotoxizitätstest wurde mit H9 EBs geführt, um einen IC 10 -Wert (Verringerung der Lebensfähigkeit um 10%) für die Zytotoxizität von Methylquecksilber (Figur 1) erhalten. Wir führten auch eine Microarray-basierte (Affymetrix-Plattform) Biomarker-Studie. Die H9 EBs wurden Methylquecksilber (0,25 und 1 & mgr; M) für 14 Tage ausgesetzt wurde. Am Tag 14 wurden Proben unter Verwendung von TRIzol gesammelt und RNA…

Discussion

Traditionelle Ansätze zur toxikologischen Prüfung beinhalten umfangreiche Tierversuche damit Tests teuer und zeitaufwendig. Darüber hinaus aufgrund der Unterschiede zwischen den Arten die vorklinischen Tiersicherheitsstudien sind nicht immer gültig Toxizität Auswirkungen möglicher Medikamente für den Menschen relevant vorherzusagen. Obwohl nichtmenschliche Primaten sind sehr vorhersehbar, noch starke ethische und sozioökonomischer Anforderungen schnell Anhebung von modernen Gesellschaften für die Entwicklung em…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

References

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Citer Cet Article
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

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