Konsantre Su Bazlı Virüsler ve Tarım Zoonotik Patojenler için Cam Yünü Filtreler
Summary
Cam yünü filtreler dünyada araştırma gruplarının bir dizi su bazlı virüsler kullanılır konsantre edilmiştir. Burada cam yünü filtreleri oluşturmak için basit bir yaklaşım göstermek ve filtreleri de su kaynaklı viral, bakteriyel ve parazitik patojenlerde konsantre etkilidir göstermektedir.
Abstract
Şüpheli kontamine su patojen seviyelerini değerlendirmek için önemli bir ilk adım yoğunlaşmasıdır. Konsantrasyon yöntemleri örneğin, örnekleme programını birden fazla patojen grubunu hedef ise birden çok yöntem gereklidir anlamına gelir Giardia ve Cryptosporidium 1, ABD Çevre Koruma Ajansı Yöntem 1623 belirli bir patojen grubu için özel olma eğilimindedir. Mevcut yöntem diğer bir dezavantajı, ekipman, örneğin, virüsler 2 yoğunlaştırmak için 1MDS kartuş filtre ile VIRADEL yöntemi komplike ve pahalı olabilir. Bu yazıda su kaynaklı patojenler yoğunlaştırmak için cam yünü filtreler oluşturmak için nasıl açıklar. Filtre elüsyon sonra, konsantre kültürel veya moleküler yöntemlerle patojen tespiti ve sayımı takip gibi santrifüj gibi ikinci bir konsantrasyon adım, için uygundur. Filtreleri çeşitli avantajları var. İnşaat kolaydır ve filtreler ile inşa edilebilirözel örnekleme gereksinimlerini karşılamak için ny boyutu. Filtre parça mümkün ciddi bir proje bütçe etkilemeden örnekleri, çok sayıda toplamak için yapım ucuzdur. Büyük örnek hacimleri (100s 1,000 L) örnek bulanıklık gelen tıkanma oranına bağlı olarak konsantre edilebilir. Filtreleri son derece taşınabilir ve böyle bir pompa ve akış metre gibi az ekipman ile, onlar bitmiş içme suyu, yüzey suyu, yeraltı suyu ve tarımsal yüzey akış örnekleme alanında uygulanabilir. Son olarak, cam yünü filtrasyon sadece tek bir yöntem gerekli olduğu şekilde patojen çeşitli tiplerde konsantre için etkilidir. Burada su bazlı insan entero, S almonella enterica, Cryptosporidium parvum, ve kuş gribi virüsü konsantre filtre etkinliği üzerine rapor.
Protocol
Discussion
Cam yünü filtreleri gibi bitmiş içme suyu 7, yeraltı 8,9, yüzey suyu 10, deniz suyu 11, atıksu 12 olarak su kaynaklarının çeşitli insan Enterik virüsler konsantre birçok araştırma ekipleri 3,5,6 tarafından kullanılan ve edilmiştir tarım akış 13. Burada filtreler de kuş gribi virüsü gibi bakteriyel ve parazitik patojenlerde sırasıyla Salmonella enterica (serovar Typhimurium) ve Cryptosporidium parvum, …
Divulgations
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Biz Video anlatan William T. Eckert teşekkür ederim. Cam yünü protokolün geliştirilmesi US EPA YILDIZ Grant R831630 tarafından finanse Enterik Riskler (WAHTER Study) için Wisconsin Su ve Sağlık Deneme parçasıydı. Alaska örnekleri USGS mali desteği ile A. Reeves, A. Ramey ve B. Meixell toplanmıştır. Ticaret, ürün veya firma adları her türlü kullanımı açıklayıcı amaçlıdır ve ABD Hükümeti tarafından onaylandığı anlamına gelmez.
Materials
| Name of reagent or item | Company | Catalogue number |
| Hydrochloric acid | Fisher Scientific | A144-500 |
| Sodium hydroxide | Fisher Scientific | BP359-212 |
| Phosphate Buffered Saline Sodium chloride Potassium phosphate-dibasic Potassium phosphate-monobasic |
Fisher Scientific Fisher Scientific Fisher Scientific |
BP358-212 BP363-500 BP362-500 |
| Sodium hypochlorite i.e., household bleach | The Clorox Co. | |
| Sodium thiosulfate, anhydrous | Fisher Scientific | S 475-212 |
| Beef extract, desiccated | Becton, Dickinson and Company | 211520 |
| Glycine | Fisher Scientific | G46-500 |
| Oiled sodocalcic glass wool
Or R-11 unfaced fiberglass insulation |
Isover
Johns Manville |
Bourre 725 QN |
| Polypropylene mesh | Industrial Netting | xN4510 |
| 2″x4″ Sch 80 PVC threaded pipe nipple | Grainger | 6MW35 |
| 2″ Sch 40 PVC cap | Grainger | 5WDW3 |
| Male adapter nylon fitting (1/2″x1/2″) | US Plastic Corp. | 62178 |
| Sample bottles for eluate- 1 liter | Fisher Scientific | 03-313-4F |
| 60 mL syringe | Fisher Scientific | NC9661991 |
| pH strips | Whatman | 2614 991 |
| Prefilter, Polypropylene, 10 inch cartridge, 10 μm | McMaster-Carr | 4411K75 |
| Prefilter housing | Cole-Parmer | S-29820-10 |
References
- US Environmental Protection Agency. Method 1623: Cryptosporidium and Giardia in Water by Filtration/IMS/FA. EPA 815-R-05-002. , (2012).
- Cashdollar, J. L., Dahling, D. R. Evaluation of a method to re-use electropositive cartridge filters for concentrating viruses from tap and river water. J. Virol. Methods. 132, 13-17 (2006).
- Lambertini, E. Concentration of enteroviruses, adenoviruses, and noroviruses from drinking water by use of glass wool filters. Appl. Environ. Microbiol. 74, 2990-2996 (2008).
- Spackman, E. Development of a real-time reverse transcription PCR assay for Type A influenza virus and the avian H5 and H7 hemagglutinin subtypes. J. Clin. Microbiol. 40, 3256-3260 (2002).
- Environment Agency. Optimisation of a new method for detection of viruses in groundwater. Report No. NC/99/40. , (2000).
- Vilaginés, P., Sarrette, B., Husson, G., Vilaginés, R. Glass wool for virus concentration at ambient water pH level. Water Sci. Technol. 27, 299-306 (1993).
- Vivier, J. C., Ehlers, M. M., Grabow, W. O. Detection of enteroviruses in treated drinking water. Water Res. 38, 2699-2705 (2004).
- Powell, K. L., Sililo, O. . Enteric virus detection in groundwater using a glass wool trap. In: Groundwater: Past Achievements and Future Challenges. , 813-816 (2000).
- Hunt, R. J., Borchardt, M. A., Richards, K. D., Spencer, S. K. Assessment of sewer source contamination of drinking water wells using tracers and human enteric viruses. Environ. Sci. Technol. 44, 7956-7963 (2010).
- van Heerden, J., Ehlers, M. M., Heim, A., Grabow, W. O. Prevalence, quantification and typing of adenoviruses detected in river and treated drinking water in South Africa. J. Appl. Microbiol. 99, 234-242 (2005).
- Vilaginés, P. Round robin investigation of glass wool method for poliovirus recovery from drinking water and sea water. Water Sci. Technol. 35, 445-449 (1997).
- Gantzer, C., Senouci, S., Maul, A., Levi, Y., Schwartzbrod, L. Enterovirus genomes in wastewater: concentration on glass wool and glass powder and detection by RT-PCR. J. Virol. Methods. 65, 265-271 (1997).
- Borchardt, M. A., Jokela, W. E., Spencer, S. K. Pathogen losses in surface water runoff from dairy manure applied to corn fields. , (2011).
- Deboosere, N. Development and validation of a concentration method for the detection of influenza A viruses from large volumes of surface water. Appl. Environ. Microbiol. 77, 3802-3808 (2011).
- Lambertini, E. Virus contamination from operation and maintenance practices in small drinking water distribution systems. J. Water Health. 9, 799-812 (2011).
