Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids

Miriam Wandres; Denise Aigner; Nicolai Kastelic; Anastasiya Boltengagen; Agnieszka Rybak-Wolf; Nikolaus Rajewsky

doi:10.3791/66225

Journal

Biologie du développement

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

March 29, 2024

Génération et analyse en aval de transcriptomes unicellulaires et mononucléiaux dans des organoïdes cérébraux

02:19 min

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Isolement de cellules uniques à partir d’organoïdes cérébraux humains pour le séquençage de l’ARN unicellulaire

01:38 min

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Isolement de noyaux uniques à partir d’organoïdes cérébraux humains pour le séquençage de l’ARN à noyau unique

01:55 min

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Miriam Wandres*^1,2, Denise Aigner*^1,2, Nicolai Kastelic^1,3, Anastasiya Boltengagen¹, Agnieszka Rybak-Wolf^1,3, Nikolaus Rajewsky^1,2

¹Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC), ²Institut für Biologie,Humboldt-Universität zu Berlin, ³Organoid platform, Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)

Summary

Ici, nous présentons un protocole complet pour la génération et l’analyse en aval d’organoïdes cérébraux humains à l’aide du séquençage de l’ARN unicellulaire et mononucléique.

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

Génération et analyse en aval de transcriptomes unicellulaires et mononucléiaux dans des organoïdes cérébraux

Isolement de cellules uniques à partir d’organoïdes cérébraux humains pour le séquençage de l’ARN unicellulaire

Isolement de noyaux uniques à partir d’organoïdes cérébraux humains pour le séquençage de l’ARN à noyau unique

Summary

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