Här presenterar vi ett protokoll för snabb identifiering av proteiner som produceras av genomiskt sekvenserade patogena bakterier med MALDI-TOF-TOF tandem masspektrometri och uppifrån och ner proteomisk analys med programvara som utvecklats internt. Metastabila proteinjoner fragment på grund av aspartsyra effekten och denna specificitet utnyttjas för protein identifiering.
Fagerquist, C. K., Rojas, E. Identification of Antibacterial Immunity Proteins in Escherichia coli using MALDI-TOF-TOF-MS/MS and Top-Down Proteomic Analysis. J. Vis. Exp. (171), e62577, doi:10.3791/62577 (2021).