Journal
/
Genética
/
En virtuell maskinplattform för icke-datorproffs för att använda djupinlärning för att klassificera biologiska sekvenser av metagenomiska data
JoVE Revista
Genética
Author Produced
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

En virtuell maskinplattform för icke-datorproffs för att använda djupinlärning för att klassificera biologiska sekvenser av metagenomiska data

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Capítulos

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Den här självstudien beskriver en enkel metod för att konstruera en djup inlärningsalgoritm för att utföra 2-klassssekvensklassificering av metagenomiska data.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

En Robotic plattform för hög kapacitet Protoplast Isolering och Transformation

Störningar av cirkulerande miRNAs i Irritable Bowel Syndrome detekteras med hjälp av en Multiplex hög kapacitet Gene Expression Platform

Metagenomic Analys av ensilage

Med hjälp av en GFP-märkta TMEM184A Construct för Bekräftelse av Heparin Receptor Identity

Protokoll för C-Brick-DNA-standardmontering med användning av Cpfl

Robust DNA isolering och hög genomströmning sekvensering bibliotek konstruktion för herbarieexemplar

CRISPR/Cas9-medierad riktade Integration In Vivo som använder en homologi-medierad slutet att gå-baserad strategi

Datoriserad analys av sekvensdata från Batch jäst 2-Hybrid skärmar

Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)

En djup-sekvensering-assisted, spontana Suppressor skärm i den Fission jäst Schizosaccharomyces pombe

Read Article