Journal
/
Genética
/
Een virtueel machineplatform voor niet-computerprofessionals voor het gebruik van deep learning om biologische sequenties van metagenomische gegevens te classificeren
JoVE Revista
Genética
Author Produced
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een virtueel machineplatform voor niet-computerprofessionals voor het gebruik van deep learning om biologische sequenties van metagenomische gegevens te classificeren

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Capítulos

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Deze zelfstudie beschrijft een eenvoudige methode om een deep learning-algoritme te construeren voor het uitvoeren van 2-klasse sequentieclassificatie van metagenomische gegevens.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Een Robotic Platform voor High-throughput protoplastisola- en Transformatie

Verstoringen van circulerende miRNAs in het prikkelbare darm syndroom gedetecteerd met een multiplexverzending High-throughput genexpressie Platform

Metagenomic Analyse van kuilvoer

Met een GFP-gelabeld TMEM184A Construct voor bevestiging van Heparine Receptor Identity

Protocollen voor C-Brick DNA Standard Assembly met behulp van Cpf1

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

CRISPR/Cas9-gemedieerde gerichte integratie In Vivo met behulp van een homologie-gemedieerde einde deelname aan gebaseerde strategie

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Een Deep-sequencing-bijgewoonde, spontane Suppressor scherm in de kernsplijting gist Schizosaccharomyces pombe

Read Article