Her præsenterer vi en protokol for at adskille og sortere en bestemt cellepopulation fra Drosophila mandlige tilbehørs kirtler (sekundære celler) til RNA-SEKVENSERING og RT-qPCR. Celle isolation opnås gennem FACS rensning af GFP-udtrykker sekundære celler efter en flertrinsdissociation proces, der kræver dissektion, proteaser fordøjelse og mekanisk dispersion.