Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)
Capítulos
- 00:04Título
- 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
- 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
- 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
- 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
- 08:29Conclusion
Identifiering av fysiska interaktioner mellan gener och reglerande element är utmanande men har underlättats med kromosomen konformation fånga metoder. Denna ändring av protokollet 4C-seq mildrar PCR partiskhet genom att minimera överdriven amplifiering av PCR-mallar och maximerar mappability av läser genom att införliva ett tillägg restriktionsenzym digest steg.
