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円の染色体構造の次世代シーケンシングによる遺伝子制御配列の高スループット識別キャプチャ (4 C seq)
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High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
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円の染色体構造の次世代シーケンシングによる遺伝子制御配列の高スループット識別キャプチャ (4 C seq)

DOI:
10.3791/58030-v

•

09:06 min

•

October 05, 2018

•

, ,
1Division of Dermatology, Center for Pharmacogenomics, Center for the Study of Itch, Department of Medicine,Washington University School of Medicine

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Traducción Automática

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遺伝子および調節配列の物理的な相互作用の同定が困難な染色体構造をキャプチャする方法によって促進されています。これは 4 C seq プロトコルを修正は PCR テンプレートが過大に増幅を最小限に抑えることによって PCR バイアスを軽減、追加制限の酵素のダイジェスト ステップを組み込むことによって読み取りの mappability を最大化します。

Tags

4C-seqChromatin InteractionsGene Regulatory SequencesNext-generation SequencingTranscriptional RegulationPromoter-enhancer InteractionsCross-linkingRestriction DigestionCell Lysis

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