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Identificazione di High-throughput di sequenze regolatorie del Gene mediante sequenziamento di nuova generazione di cromosoma circolare conformazione catturare (4C-seq)
Capítulos
- 00:04Título
- 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
- 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
- 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
- 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
- 08:29Conclusion
L'identificazione delle interazioni fisiche tra geni ed elementi regolatori è impegnativo ma è stata facilitata dai metodi di cattura conformazione del cromosoma. Questa modifica del protocollo 4C-seq mitiga bias PCR riducendo al minimo eccessiva amplificazione dei modelli di PCR e massimizza la mappability di letture incorporando un passo di digest di aggiunta degli enzimi di limitazione.
