Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)
Capítulos
- 00:04Título
- 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
- 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
- 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
- 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
- 08:29Conclusion
De identificatie van de fysieke interacties tussen genen en regelgevende elementen is uitdagend maar heeft bevorderd door chromosoom conformatie opname methoden. Deze wijziging van het 4C-seq-protocol PCR bias vermindert door het minimaliseren van de over-amplificatie van PCR sjablonen en maximaliseert de mappability van leest door het opnemen van een toevoeging restrictie-enzym digest stap.
