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Une plate-forme de Microfluidic ultra haute capacité pour le séquençage du génome de cellules individuelles
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An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
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Une plate-forme de Microfluidic ultra haute capacité pour le séquençage du génome de cellules individuelles

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10:00 min

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May 23, 2018

DOI:

10.3791/57598-v

DOI:
10.3791/57598-v

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10:00 min
May 23, 2018

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1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Summary

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Unicellulaire séquençage révèle une hétérogénéité génotypique dans les systèmes biologiques, mais les technologies actuelles n’ont pas le débit nécessaire pour la détermination des caractéristiques profondes de la fonction et la composition de la communauté. Nous décrivons ici un "workflow" microfluidique pour séquençage > 50 000 unicellulaires génomes de diverses populations de cellules.

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Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

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Demaree, B., Weisgerber, D., Lan, F., Abate, A. R. An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing. J. Vis. Exp. (135), e57598, doi:10.3791/57598 (2018).

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