Journal
/
Genética
/
Provberedning och analys av RNASeq-baserade gen uttryck Data från zebrafisk
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Provberedning och analys av RNASeq-baserade gen uttryck Data från zebrafisk

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Detta protokoll presenterar en strategi för hela transkriptom analys från zebrafisk embryon, larver, eller sorterade celler. Vi inkluderar isolering av RNA, väg analys av RNASeq data, och qRT-PCR-baserade validering av genförändringar uttryck.

Tags

RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA SequencingBiología del desarrolloComparative Analysis

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Parallell Mätning av dygnsrytm klocka genuttryck och hormon i mänskliga primära cellkulturer

Encelliga profilering av genuttryck med FACS och qPCR med interna standarder

Studierande cellcykelreglerade genuttryck av två komplementära cellsynkroniseringsprotokoll

Tvåriktad retroviral integrationsplats PCR-metodik och kvantitativ dataanalys arbetsflöde

Mäta genuttryck i bombarderade korn Aleurone lager med ökad genomströmning

En Optogenetic metod för att kontrollera och analysera gen uttrycksmönster i Cell-till-cell interaktioner

En Ecdysone Receptor-baserade Singular gen omkopplare för avsiktlig uttryck för transgenens med robusthet, reversibilitet och försumbar Leakiness

Utforska den roten mikrobiomet: extrahera bakteriell gemenskapen Data från jord, odlingsbädden och rot Endosphere

Datoriserad analys av sekvensdata från Batch jäst 2-Hybrid skärmar

Att upprätthålla biologiska kulturer och mäta genuttryck i Aphis nerii: icke-modellsystem för växt-insekt interaktioner

Read Article