Journal
/
Genética
/
Genom-bred kortlægning af protein-DNA-interaktioner med ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions with ChEC-seq in Saccharomyces cerevisiae

Genom-bred kortlægning af protein-DNA-interaktioner med ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em

DOI:
10.3791/55836-v

•

10:43 min

•

June 03, 2017

•

,
1Basic Sciences Division,Fred Hutchinson Cancer Research Center, 2Department of Biology,Indiana University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:49Chromatin Endogenous Cleavage (ChEC)
  • 06:30Size Selection
  • 08:28Results: ChEC-seq Enables Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions
  • 09:54Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Vi beskriver chromatin endogen spaltning kombineret med høj gennemstrømningssekvensering (ChEC-seq), en chromatinimmunpræcipitation (ChIP) -orthogonal metode til kortlægning af proteinbindingssteder, som er genomsamlede med mikrokocelle nuklease (MNase) fusionsproteiner.

Tags

ChEC-seqProtein-DNA InteractionsGenome-wide MappingSaccharomyces CerevisiaeTranscriptionChromatinDNA BindingRegulatory FactorsHigh ResolutionLow BackgroundFormaldehyde CrosslinkingChromatin SolubilizationAntibodiesMNaseCalcium AdditionStop SolutionSDS

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Genom-dækkende Bestemmelse af pattedyr Replication Timing ved DNA Content Measurement

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen

Kortlægning Genome-wide tilgængelige kromatin i primære humane T lymfocytter af ATAC-Seq

Bestemmelse af Genome-wide udskrift henfald priser i prolifererende og inaktiv humane fibroblaster

Generation af Genome-wide kromatin kropsbygning Capture biblioteker fra stramt iscenesatte tidlige Drosophila embryoner

Kromatin Immunoprecipitation (ChIP) af Histon ændringer fra Saccharomyces cerevisiae

Promotor Capture Hej-C: Høj opløsning, Genome-wide profilering af promotor interaktioner

Genom-dækkende overvågning af transskription fejl i Eukaryote organismer

Saccharomyces cerevisiae Metaboliske mærkning med 4-thiouracil og kvantificering af nyligt syntetiserede mRNA som en Proxy for RNA Polymerase II aktivitet

Genetisk kortlægning af termo Toleranceforskelle mellem arter af Saccharomyces gær via Genome-Wide gensidig Hemizygosity analyse

Read Article