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Mapeamento genômico de interações proteína-DNA com ChEC-seq em<em> Saccharomyces cerevisiae</em
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JoVE Revista Genética
Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions with ChEC-seq in Saccharomyces cerevisiae

Mapeamento genômico de interações proteína-DNA com ChEC-seq em<em> Saccharomyces cerevisiae</em

DOI:
10.3791/55836-v

•

10:43 min

•

June 03, 2017

•

,
1Basic Sciences Division,Fred Hutchinson Cancer Research Center, 2Department of Biology,Indiana University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:49Chromatin Endogenous Cleavage (ChEC)
  • 06:30Size Selection
  • 08:28Results: ChEC-seq Enables Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions
  • 09:54Conclusion

Summary

Traducción Automática

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Nós descrevemos a clivagem endógena da cromatina, juntamente com a sequenciação de alto rendimento (ChEC-seq), um método ortogonal de imunoprecipitação com cromatina (ChIP) para mapear os locais de ligação de proteínas genômicas com proteínas de fusão de nucleases microcócicas (MNase).

Tags

ChEC-seqProtein-DNA InteractionsGenome-wide MappingSaccharomyces CerevisiaeTranscriptionChromatinDNA BindingRegulatory FactorsHigh ResolutionLow BackgroundFormaldehyde CrosslinkingChromatin SolubilizationAntibodiesMNaseCalcium AdditionStop SolutionSDS

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