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Microarray-basierte Identifizierung von Einzel HERV Expression Loci: Anwendung auf Biomarker Discovery in Prostatakrebs
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13:19 min
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November 02, 2013
DOI:
1Joint Unit Hospices de Lyon-bioMérieux, 2Medical Diagnostic Discovery Department,BioMérieux, 3Department of Pathology and Cytology, Centre Hospitalier Lyon Sud,Hospices Civils de Lyon, 4Medical Faculty,Lyon 1 University, 5Data and Knowledge Laboratory,BioMérieux, 6Department of Biochemistry and Molecular Biology, Centre Hospitalier Lyon Sud,Hospices Civils de Lyon, 7Department of Urology, Centre Hospitalier Lyon Sud,Hospices Civils de Lyon
Summary
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Humanen endogenen Retroviren (HERV), die 8% des menschlichen Genoms zu besetzen, halten knapp Codierung Kapazitäten aber hunderttausend long terminal repeats (LTR). Eine benutzerdefinierte Affymetrix-Microarray wurde entwickelt, um einzelne HERV Expression Ort identifizieren und wurde auf Prostata-Krebsgewebe als Proof of Concept für zukünftige klinische Studien verwendet.
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Pérot, P., Cheynet, V., Decaussin-Petrucci, M., Oriol, G., Mugnier, N., Rodriguez-Lafrasse, C., Ruffion, A., Mallet, F. Microarray-based Identification of Individual HERV Loci Expression: Application to Biomarker Discovery in Prostate Cancer. J. Vis. Exp. (81), e50713, doi:10.3791/50713 (2013).
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