Här beskriver vi ett protokoll för optogenetic manipulation av motoneuronal aktivitet samtidigt övervaka förändringar i motoreffekt (muskelkontraktion) i semi-intakt<em> Drosophila</em> Larver med laser i en vanlig konfokalmikroskop. Denna teknik gör det möjligt för forskare att nå lokal störning av neural aktivitet i några neuromeres att belysa dynamiken i motoriska kretsar.