Journal
/
/
Geautomatiseerde Sholl Analyse van Gedigitaliseerde Neuronale morfologie op meerdere schalen
JoVE Revista
Neurociencias
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Neurociencias
Automated Sholl Analysis of Digitized Neuronal Morphology at Multiple Scales
DOI:

11:41 min

November 14, 2010

, , , ,

Capítulos

  • 00:00Título
  • 00:20Introduction
  • 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
  • 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
  • 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
  • 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
  • 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
  • 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
  • 11:21Conclusion

Summary

Traducción Automática

We hebben een computerprogramma ontwikkeld om neuronale morfologie te analyseren. In combinatie met de twee bestaande open source analyse-instrumenten, ons programma voert Sholl analyse en bepaalt het aantal neurieten, branche punten en neurieten tips. De analyses zijn zo uitgevoerd dat de lokale veranderingen in de morfologie van neurieten kan worden waargenomen.

Videos relacionados

Read Article