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Analyse automatisée des Sholl morphologie neuronale numérisés à de multiples échelles
JoVE Revista
Neurociencias
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JoVE Revista Neurociencias
Automated Sholl Analysis of Digitized Neuronal Morphology at Multiple Scales
DOI:

11:41 min

November 14, 2010

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Capítulos

  • 00:00Título
  • 00:20Introduction
  • 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
  • 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
  • 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
  • 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
  • 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
  • 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
  • 11:21Conclusion

Summary

Traducción Automática

Nous avons développé un programme informatique pour analyser la morphologie des neurones. En combinaison avec deux ouverts existants des outils d'analyse de source, notre programme effectue une analyse Sholl et détermine le nombre de neurites, points de branchement, et des conseils neurites. Les analyses sont effectuées de telle sorte que les modifications locales dans la morphologie des neurites peut être observée.

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