Summary

To peelingmetoder til isolering af fotoreceptorcellerum i musenehinden til proteinanalyse

Published: December 07, 2021
doi:

Summary

Denne protokol præsenterer to teknikker til at isolere de subcellulære rum af murine stang fotoreceptorer til proteinanalyse. Den første metode bruger levende nethinde- og cellulosefilterpapir til at adskille stangens ydre segmenter, mens den anden anvender lyofiliseret nethinde og klæbebånd til at skrælle stangens indre og ydre segmentlag væk.

Abstract

Rodfotoreceptorer er stærkt polariserede sensoriske neuroner med forskellige rum. Musestænger er lange (~ 80 μm) og tynde (~ 2 μm) og pakkes sideværts i det yderste lag af nethinden, fotoreceptorlaget, hvilket resulterer i justering af analoge subcellulære rum. Traditionelt er tangentiel sektionering af den frosne fladmonterede nethinde blevet brugt til at studere bevægelsen og lokaliseringen af proteiner inden for forskellige stangrum. Den høje krumning af den stangdominerende musenehinden gør imidlertid tangentiel sektionering udfordrende. Motiveret af undersøgelsen af proteintransport mellem rum udviklede vi to skrælningsmetoder, der pålideligt isolerer stangens ydre segment (ROS) og andre subcellulære rum til vestlige pletter. Vores relativt hurtige og enkle teknikker leverer berigede og subcellulære specifikke fraktioner til kvantitativt at måle fordelingen og omfordelingen af vigtige fotoreceptorproteiner i normale stænger. Desuden kan disse isolationsteknikker også let tilpasses til at isolere og kvantitativt undersøge proteinsammensætningen af andre cellulære lag inden for både sund og degenererende nethinde.

Introduction

Rodfotoreceptorceller, tæt pakket i det yderste lag af den neurale nethinde, er en integreret del af svagt lyssyn. For at fungere som trofaste fotontællere bruger stænger en G-proteinbaseret signalvej, nævnt fototransduktion, til at generere hurtige, forstærkede og reproducerbare reaktioner på enkelt fotonoptagelse. Denne reaktion på lys udløser i sidste ende en ændring i strømmen ved plasmamembranen og signaleres efterfølgende til resten af det visuelle system1. Som navnet antyder, har hver stangcelle en særskilt stanglignende form og udviser en stærkt polariseret cellulær morfologi, der består af et ydre segment (OS), indre segment (IS), cellelegeme (CB) og synaptisk terminal (ST). Hvert subcellulært rum har specifikke proteinmaskiner (membranbundne og opløselige), biomolekylære egenskaber og proteinkomplekser, der spiller afgørende roller såsom visuel fototransduktion, generel husholdning og proteinsyntese og synaptisk transmission2,3.

For over 30 år siden blev den lysafhængige gensidige bevægelse af subcellulære proteiner, specifikt transducin (væk fra operativsystemet) og arrestin (mod operativsystemet), først observeret4,5,6,7. Tidligt blev dette observerede fænomen modtaget med skepsis, delvis på grund af immunhistokemiens sårbarhed over for epitopmaskering8. I begyndelsen af 2000’erne blev stimulusafhængig proteintranslokation bekræftet ved hjælp af en streng og besværlig fysisk sektioneringsteknik9. Seriel tangentiel sektionering af den frosne fladmonterede gnaver nethinde efterfulgt af immunoblotting afslørede, at transducin9,10, arrestin11,12 og recoverin13 alle gennemgår subcellulær omfordeling som reaktion på lys. Det antages, at lysdrevet translokation af disse vigtige signalproteiner ikke kun regulerer følsomheden af fototransduktionskaskaden9,14,15, men kan også være neurobeskyttende mod lysskader16,17,18. Fordi lysdrevet proteintransport i stænger synes at være meget vigtig for stangcellebiologi og fysiologi, er teknikker, der tillader isolering af forskellige subcellulære rum til bestemmelse af proteinfordeling, værdifulde forskningsværktøjer.

I øjeblikket er der et par metoder, der tager sigte på at isolere stangens subcellulære rum. Disse metoder kan dog være langvarige og vanskelige at reproducere eller kræve en betydelig mængde retinal isolat. Stangens ydre segment (ROS) præparater via densitetsgradientcentrifugering19 anvendes for eksempel almindeligvis til at adskille ROS fra retinal homogenat. Denne metode anvendes i vid udstrækning til western blot, men proceduren er meget tidskrævende og kræver mindst 8-12 murine retinae20. På den anden side er seriel tangentiel sektionering af frossen murine og rotte nethinde blevet implementeret med succes i isolering af OS, IS, CB og ST9,11,13. Denne metode er imidlertid teknisk udfordrende på grund af nødvendigheden af fuldt ud at flade den lille og stærkt buede murin nethinde for at justere retinale lag inden tangentiel sektionering. Da der er en overflod af musemodeller og transgene mus, der rekapitulerer sygdomme i det visuelle system, er oprettelsen af en teknik, der pålideligt, hurtigt og let adskiller individuelle stangrum, lovende med at afsløre de fysiologiske processer, der forekommer i hvert specialiseret rum og de mekanismer, der ligger til grund for visuelle processer inden for sundhed og sygdom.

For at lette disse undersøgelser beskriver vi to skrælningsmetoder, der lettere isolerer stangens subcellulære rum end de nuværende protokoller. Den første peelingmetode, der er tilpasset fra en teknik til at udsætte fluorescerende mærkede bipolære celler til optagelse af plasterklemmer21, anvender cellulosefilterpapir til sekventielt at fjerne ROS fra en levende, isoleret murin nethinde (figur 1). Den anden metode, tilpasset fra en procedure, der isolerer de tre primære retinale cellelag fra en chick22 og frog23 nethinden, bruger klæbebånd til at fjerne ROS og stangens indre segment (RIS) fra en lyofiliseret nethinden (figur 2). Begge procedurer kan gennemføres på 1 time og er betydeligt brugervenlige. Vi leverer validering af effektiviteten af disse to separationsprotokoller for western blot ved at anvende mørketilpasset og lyseponeret nethinde fra C57BL/6J-mus til at demonstrere lysinduceret translokation af stangtransducin (GNAT1) og arrestin (ARR1). Desuden giver vi ved hjælp af båndskrælningsmetoden yderligere bevis for, at vores teknik kan bruges til at undersøge og adressere uoverensstemmelser mellem proteinlokaliseringsdata erhvervet af immunocytokemi (ICC) og vestlige blots. Specifikt viste vores teknik, at: 1) proteinkinase C-alfa (PKCα) isoform er til stede ikke kun i bipolære celler, men også i murin ROS og RIS, omend i lave koncentrationer24,25, og 2) rhodopsinkinase (GRK1) er overvejende til stede i den isolerede OS-prøve. Disse data viser effektiviteten af vores to peelingteknikker til adskillelse og kvantificering af specifikke stang- og retinale proteiner.

Protocol

Alle forsøg blev udført i henhold til de lokale institutionelle retningslinjer fra udvalget for forskning dyrepleje fra University of Southern California (USC). 1. Levende celle retinal peeling metode Tilberedning af Ames ‘buffere, skrælpapir og dissektionsskål Brug stump spids iris saks (eller tilsvarende saks type) skære cellulosefilterpapiret (Grade 413) i rektangler, der måler ca. 5 mm x 2,5 mm. Opbevar stiklinger til fremtidig brug. Forb…

Representative Results

De nuværende strategier blev udviklet til at give relativt hurtige og enkle metoder til at isolere og analysere proteiner blandt specifikke stang subcellulære rum til western blot analyse. Vi anvendte to sekventielle peelingteknikker (figur 1 og figur 2) efterfulgt af immunoblotting for at påvise, at disse metoder pålideligt kunne anvendes til at påvise den kendte fordeling af stangtransducin (GNAT1) og arrestin (ARR1) hos både mørke- og lystilpassede dyr…

Discussion

Mange retinale sygdomme påvirker stangfotoreceptorceller, hvilket fører til stangdød og i sidste ende fuldstændigt synstab37. En betydelig del af den genetiske og mekanistiske oprindelse af menneskelig retinal degeneration er med succes blevet rekapituleret i adskillige musemodeller gennem årene. I den sammenhæng vil evnen til let og selektivt at adskille individuelle stang subcellulære rum fra den lille muse nethinde i høj grad forbedre vores forståelse af de lokaliserede biokemiske og m…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbejde blev støttet af NIH Grant EY12155, EY027193 og EY027387 til JC. Vi er taknemmelige over for Dr. Spyridon Michalakis (Caltech, Pasadena, USA) og Natalie Chen (USC, Los Angeles, USA) for korrekturlæsning af manuskriptet. Vi vil også gerne takke Dr. Seth Ruffins (USC, Los Angeles, USA) og Dr. Janos Peti-Peterdi (USC, Los Angeles, USA) for at have leveret det nødvendige udstyr til at indsamle forfatteren leverede optagelser. Materiale fra: Kasey Rose et al,Separation of photoreceptor cell compartments in mouse netina for protein analysis, Molecular Neurodegeneration, offentliggjort [2017], [Springer Nature].

Materials

100 mL laboratory or media bottle equipped with a tubing cap adapter N/A N/A
100% O2 tank N/A N/A
1000mL Bottle Top Filter, PES Filter Material, 0.22 μm Genesee Scientific 25-235
4X SDS Sample Buffer Millipore Sigma 70607-3
50 mL Falcon tube Fisher Scientific 14-432-22
95% O2 and 5% CO2 tank N/A N/A
Ames’ Medium with L-glutamine, without bicarbonate Sigma-Aldrich A1420
CaCl2 (99%, dihydrate) Sigma C-3881
Drierite (Anhydrous calcium sulfate, >98% CaSO4, >2% CoCl2) WA Hammond Drierite Co LTD 21005
Falcon Easy-Grip Petri Dish (polystyrene, 35 x 10 mm) Falcon-Corning 08-757-100A
Falcon Easy-Grip Tissue Culture Dish (60 x 15 mm) Falcon-Corning 08-772F
Feather Scalpel (No. 10, 40 mm) VWR 100499-578
Feather Scalpel (No. 11, 40 mm) VWT 100499-580
KCl (99%) Sigma P-4504
Kimble Kontes pellet pestle Sigma z359971
Labconco Fast-Freeze Flasks Labconco N/A
LN2 (liquid nitrogen) + Dewar flask or similar vacuum flask N/A N/A
MgCl2 Sigma M-9272
Milli-Q/de-ionized water EMD Millipore N/A
Na2HPO4 (powder) J.T. Baker 4062-01
NaCl (crystal) EMD Millipore Sx0420-3
NaHCO3 Amresco 0865
OmniPur EDTA EMD 4005
OmniPur HEPES, Free Acid EMD 5320
Parafilm M Sigma-Aldrich P7793
Reynolds Wrap Aluminum Foil Reynolds Brands N/A
Scotch Magic Tape (12.7 mm x 32.9 m) Scotch-3M N/A
Sodium deoxycholate Sigma-Aldrich D67501
Spectrafuge mini centrifuge Labnet International, Inc C1301
Tissue incubation chamber (purchased or custom made) N/A N/A
Tris-HCl J.T.Baker 4103-02
Triton X-100 Signma-Aldrich T8787
VirTis Benchtop 2K Lyophilizer or equivalent machine SP Scientific N/A
VWR Grade 413 Filer Paper (diameter 5.5 cm, pore size 5 μm) VWR 28310-015
Whatman Grade 1 Qualitative Filter Paper (diameter 9 cm, pore size 11 μm) Whatman/GE Healthcare 1001-090
Wide bore transfer pipet, Global Scientific VWR 76285-362

Referencias

  1. Arshavsky, V. Y., Lamb, T. D., Pugh, E. N. G proteins and phototransduction. Annual Review of Physiology. 64, 153-187 (2002).
  2. Molday, R. S., Moritz, O. L. Photoreceptors at a glance. Journal of Cell Science. 128 (22), 4039-4045 (2015).
  3. Koch, K. W., Dell’Orco, D. Protein and signaling networks in vertebrate photoreceptor cells. Frontiers in Molecular Neuroscience. 8, 67 (2015).
  4. Semple-Rowland, S. L., Dawson, W. W. Cyclic light intensity threshold for retinal damage in albino rats raised under 6 lx. Experimental Eye Research. 44 (5), 643-661 (1987).
  5. Brann, M. R., Cohen, L. V. Diurnal expression of transducin mRNA and translocation of transducin in rods of rat retina. Science. 235 (4788), 585-587 (1987).
  6. Philp, N. J., Chang, W., Long, K. Light-stimulated protein movement in rod photoreceptor cells of the rat retina. FEBS Letters. 225 (1-2), 127-132 (1987).
  7. Broekhuyse, R. M., Tolhuizen, E. F., Janssen, A. P., Winkens, H. J. Light induced shift and binding of S-antigen in retinal rods. Current Eye Research. 4 (5), 613-618 (1985).
  8. Roof, D. J., Heth, C. A. Expression of transducin in retinal rod photoreceptor outer segments. Science. 241 (4867), 845-847 (1988).
  9. Sokolov, M., et al. Massive light-driven translocation of transducin between the two major compartments of rod cells: a novel mechanism of light adaptation. Neuron. 34 (1), 95-106 (2002).
  10. Lobanova, E. S., et al. Transducin translocation in rods is triggered by saturation of the GTPase-activating complex. The Journal of Neuroscience. 27 (5), 1151-1160 (2007).
  11. Strissel, K. J., Sokolov, M., Trieu, L. H., Arshavsky, V. Y. Arrestin translocation is induced at a critical threshold of visual signaling and is superstoichiometric to bleached rhodopsin. The Journal of Neuroscience. 26 (4), 1146-1153 (2006).
  12. Nair, K. S., et al. Light-dependent redistribution of arrestin in vertebrate rods is an energy-independent process governed by protein-protein interactions. Neuron. 46 (4), 555-567 (2005).
  13. Strissel, K. J., et al. Recoverin undergoes light-dependent intracellular translocation in rod photoreceptors. The Journal of Biological Chemistry. 280 (32), 29250-29255 (2005).
  14. Calvert, P. D., Strissel, K. J., Schiesser, W. E., Pugh, E. N., Arshavsky, V. Y. Light-driven translocation of signaling proteins in vertebrate photoreceptors. Trends in Cell Biology. 16 (11), 560-568 (2006).
  15. Majumder, A., et al. Transducin translocation contributes to rod survival and enhances synaptic transmission from rods to rod bipolar cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (30), 12468-12473 (2013).
  16. Fain, G. L. Why photoreceptors die (and why they don’t). BioEssays. 28 (4), 344-354 (2006).
  17. Chen, J., Simon, M. I., Matthes, M. T., Yasumura, D., LaVail, M. M. Increased susceptibility to light damage in an arrestin knockout mouse model of Oguchi disease (stationary night blindness). Investigative Ophthalmology & Visual Science. 40 (12), 2978-2982 (1999).
  18. Song, X., et al. Arrestin-1 expression level in rods: balancing functional performance and photoreceptor health. Neurociencias. 174, 37-49 (2011).
  19. McConnell, D. G. The isolation of retinal outer segment fragments. The Journal of Cell Biology. 27 (3), 459-473 (1965).
  20. Tsang, S. H., et al. Role for the target enzyme in deactivation of photoreceptor G protein in vivo. Science. 282 (5386), 117-121 (1998).
  21. Walston, S. T., Chow, R. H., Weiland, J. D. Patch clamp recordings of retinal bipolar cells in response to extracellular electrical stimulation in wholemount mouse retina. Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. 2015, 3363-3366 (2015).
  22. Guido, M. E., et al. A simple method to obtain retinal cell preparations highly enriched in specific cell types. Suitability for lipid metabolism studies. Brain Research. Brain Research Protocols. 4 (2), 147-155 (1999).
  23. Hayashi, F., et al. Phosphorylation by cyclin-dependent protein kinase 5 of the regulatory subunit of retinal cGMP phosphodiesterase. II. Its role in the turnoff of phosphodiesterase in vivo. The Journal of Biological Chemistry. 275 (42), 32958-32965 (2000).
  24. Wolbring, G., Cook, N. J. Rapid purification and characterization of protein kinase C from bovine retinal rod outer segments. European Journal of Biochemistry. 201 (3), 601-606 (1991).
  25. Williams, D. S., et al. Characterization of protein kinase C in photoreceptor outer segments. Journal of Neurochemistry. 69 (4), 1693-1702 (1997).
  26. Watson, A. J., Aragay, A. M., Slepak, V. Z., Simon, M. I. A novel form of the G protein beta subunit Gbeta5 is specifically expressed in the vertebrate retina. The Journal of Biological Chemistry. 271 (45), 28154-28160 (1996).
  27. Makino, E. R., Handy, J. W., Li, T., Arshavsky, V. Y. The GTPase activating factor for transducin in rod photoreceptors is the complex between RGS9 and type 5 G protein beta subunit. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (5), 1947-1952 (1999).
  28. Chen, J., Shi, G., Concepcion, F. A., Xie, G., Oprian, D. Stable rhodopsin/arrestin complex leads to retinal degeneration in a transgenic mouse model of autosomal dominant retinitis pigmentosa. The Journal of Neuroscience. 26 (46), 11929-11937 (2006).
  29. Chen, C. K., et al. Abnormal photoresponses and light-induced apoptosis in rods lacking rhodopsin kinase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (7), 3718-3722 (1999).
  30. Zhang, H., et al. Mistrafficking of prenylated proteins causes retinitis pigmentosa 2. FASEB Journal. 29 (3), 932-942 (2015).
  31. Weiss, E. R., et al. Species-specific differences in expression of G-protein-coupled receptor kinase (GRK) 7 and GRK1 in mammalian cone photoreceptor cells: implications for cone cell phototransduction. The Journal of Neuroscience. 21 (23), 9175-9184 (2001).
  32. Zhao, X., Huang, J., Khani, S. C., Palczewski, K. Molecular forms of human rhodopsin kinase (GRK1). The Journal of Biological Chemistry. 273 (9), 5124-5131 (1998).
  33. Newton, A. C., Williams, D. S. Involvement of protein kinase C in the phosphorylation of rhodopsin. The Journal of Biological Chemistry. 266 (27), 17725-17728 (1991).
  34. Pinzon-Guzman, C., Zhang, S. S., Barnstable, C. J. Specific protein kinase C isoforms are required for rod photoreceptor differentiation. The Journal of Neuroscience. 31 (50), 18606-18617 (2011).
  35. Sokal, I., et al. Identification of protein kinase C isozymes responsible for the phosphorylation of photoreceptor-specific RGS9-1 at Ser475. The Journal of Biological Chemistry. 278 (10), 8316-8325 (2003).
  36. Rose, K., Walston, S. T., Chen, J. Separation of photoreceptor cell compartments in mouse retina for protein analysis. Molecular Neurodegeneration. 12 (1), 28 (2017).
  37. Wright, A. F., Chakarova, C. F., Abd El-Aziz, M. M., Bhattacharya, S. S. Photoreceptor degeneration: genetic and mechanistic dissection of a complex trait. Nature Reviews. Genetics. 11 (4), 273-284 (2010).

Play Video

Citar este artículo
Rose, K., Lokappa, S., Chen, J. Two Peeling Methods for the Isolation of Photoreceptor Cell Compartments in the Mouse Retina for Protein Analysis. J. Vis. Exp. (178), e62977, doi:10.3791/62977 (2021).

View Video