Este procedimiento describe cómo encapsular citocromo c (cit. C) en sílice (SiO2) sol-gel, procesos estos geles para formar bioaerogels, y el uso de estos bioaerogels reconocer rápidamente el óxido nítrico (NO) a través de una reacción en fase gaseosa. Este tipo de protocolo puede ayudar en el futuro desarrollo de biosensores u otros dispositivos de bioanálisis.
Las aplicaciones como sensores, baterías y pilas de combustible se han mejorado mediante el uso de los aerogeles altamente porosas cuando los compuestos funcionales son encapsulados dentro de los aerogeles. Sin embargo, existen pocos informes sobre encapsular proteínas dentro de sol-geles que son procesados para formar aerogeles. Un procedimiento para la encapsulación de citocromo c (cyt. C) en sílice (SiO 2) sol-geles que se procesan para formar supercríticamente bioaerogels con actividad en fase gaseosa para el óxido nítrico (NO) se presenta. Cyt. C se añade a un sol de sílice mezclado bajo concentración de proteína controlada y el tampón condiciones de fuerza. La mezcla de sol se gelifica y el líquido de llenado de los poros del gel se sustituye a través de una serie de intercambios de disolvente con dióxido de carbono líquido. El dióxido de carbono se lleva a su punto crítico y ventilado fuera para formar aerogeles secos con cyt. C encapsulado en el interior. Estos bioaerogels se caracterizan con una espectroscopía UV-visibled espectroscopía de dicroísmo circular y se puede utilizar para detectar la presencia de óxido nítrico en fase gaseosa. El éxito de este procedimiento depende de la regulación de la concentración c cyt. Y la concentración de tampón y no requiere otros componentes tales como nanopartículas metálicas. Puede ser posible encapsular otras proteínas usando un enfoque similar haciendo de este procedimiento importante para el potencial desarrollo futuro dispositivo de bioanálisis.
El citocromo c (cyt. C) es una proteína de transferencia de electrones clave implicada en las reacciones de la respiración celular del cuerpo. Se ha demostrado estar involucrados en la apoptosis, una forma controlada de muerte celular, y se puede detectar pequeñas moléculas tóxicas tales como el óxido nítrico y el monóxido de carbono 1-3. El óxido nítrico (NO) desempeña un papel en una variedad de procesos fisiológicos que tienen lugar en los sistemas nervioso, cardiovascular y del sistema inmune. Mientras cyt. C requiere típicamente un medio acuoso tamponado a valores de pH neutro a permanecer estructuralmente intacto y activo, la investigación ha demostrado que cyt. C puede retener su estructura y función en materiales sólidos conocidos como aerogeles bajo ciertas condiciones 4-9.
Los aerogeles son materiales muy porosos a menudo formados mediante la síntesis de óxidos metálicos de sol-gel (Mientras que los aerogeles de óxido de metal son muy comunes, de carbono y otros tipos de aerogeles se han sintetizado. Un ejemplo es InP aerogels) 10 y el secado de estos sol-geles de tal manera que la matriz sólida porosa se deja sin cambios 11-14. Todos los poros de aerogeles sólidas resultan en aerogeles disponible Superficie hacer mucho extremadamente útiles para cualquier aplicación en reacciones superficiales son importantes. Cuando la funcionalidad química o bioquímica se monta dentro de la nanoarquitectura aerogel, se ha demostrado que la porosidad física y área de superficie mejorada de los aerogeles de ayuda para mejorar los sensores, así como electrodos para baterías, pilas de combustible, y aplicaciones de supercondensadores 11,15-23 . Con el fin de aerogeles de una manera que sale de la matriz sólida porosa sin cambios secar, es típico para eliminar el disolvente que queda en los poros después de la síntesis sol-gel a través de la extracción con disolvente supercrítico. Cualquier colapso de poros que puede ser causada por las fuerzas de tensión superficial como un solvente se evapora desde el gel se reducen al mínimo debido a que en el secado supercrítico, una interfaz líquido-vapor nunca forma.
<p class="jove_content"> Hay muchos informes de hemoproteínas tales como cit. c está encapsulado en sol-geles que se han mantenido húmedo o que se han secado ambiently 24-30. Informes de encapsular biomoléculas en Sol-geles que a continuación se secan supercríticamente para formar aerogeles son más raros debido al procesamiento necesario que puede ser perjudicial para la estructura de muchas proteínas. En el caso de cyt. C, ciertas condiciones hacen posible retener la capacidad de cyt. C para detectar y responder a óxido nítrico en fase gaseosa dentro de los aerogeles. Una vez estabilizado en el aerogel, la estructura de poros de alta calidad del aerogel facilita la reacción entre cyt. C y 4,8,9 óxido nítrico. Cyt. C se puede encapsular dentro de aerogeles por primera asociándolo en múltiples capas alrededor de las nanopartículas de oro o plata en la solución de 4-8. Estas superestructuras de varias capas sirven para proteger a la proteína dentro de la matriz de aerogel. En el más reciente approach que hemos desarrollado, cuando la concentración de proteína y el tampón de fuerza son controlados junto con otras condiciones sintéticas, cit. c conserva la integridad dentro de los aerogeles incluso sin nanopartícula metálica asociación inicial 9.La síntesis comienza como muchas síntesis de aerogel empiezan mezclando precursores de sílice sol-gel por un período determinado de tiempo. Es después de un tiempo que cyt. C se añade como una solución tampón en la mezcla mezclando conjunto. La gelificación se produce entonces para formar una estructura sólida de sílice porosa en la que los poros están llenos de agua, metanol, reactivos y subproductos restantes. Este líquido que llena los poros se puede enjuagar a cabo con varios disolventes a través de una serie de intercambios de disolvente, los últimos intercambios con dióxido de carbono líquido que tiene lugar dentro de un aparato de punto de secado crítico mantenerse a baja temperatura. Llevar los geles por encima de la temperatura crítica (31,1 ° C) de dióxido de carbono facilita la formación de comoupercritical fluido a presión en el interior del aparato que puede ser ventilado a formar aerogeles secos, altamente porosas. La temperatura relativamente baja requerida para el dióxido de carbono para formar un fluido supercrítico es ventajoso en comparación con otros disolventes, ya que mantiene la proteína por debajo de una temperatura a la que podría desnaturalizar.
Nuestro enfoque libre de nanopartícula metálica para encapsular cyt. C en aerogeles es ventajoso porque es un procedimiento simple que puede conducir al desarrollo de un protocolo de aplicación más general para encapsular otras proteínas también. Muchas proteínas no pueden interactuar con nanopartículas metálicas de la misma manera que cyt. C hace y la síntesis de nanopartículas de metal o la compra añade tiempo y gasto adicional para el procedimiento. Los pocos informes sobre encapsular proteínas en aerogeles hacen que el desarrollo de este procedimiento un importante paso adelante para encontrar un procedimiento más general para encapsular otras proteínas en los aerogeles que pueden ayudar in potencial de futuros dispositivos de bioanálisis.
La sección del protocolo de este manuscrito describe cómo sintetizar sílice sol-gel, encapsular cit. C en estos sol-geles, secar estos compuestos sol-gel para formar aerogeles, caracterizan a estos bioaerogels utilizando espectroscopia UV-visible y dicroísmo circular y detectar la presencia de óxido nítrico en fase gaseosa con estas bioaerogels. Cyt. C se ha encapsulado con éxito en aerogeles cuando se disuelve primero en 4,4 a 70 mM de soluciones acuosas de tampón de fosfato. Sin embargo, la estructura de proteínas optimizada en aerogeles se ha encontrado para dar lugar al encapsular 40 mM de fosfato de soluciones tamponadas de cyt. C, produciendo cyt aerogel cargado. Concentraciones de C en el intervalo de 5 a 15 micras 9. Por lo tanto, el protocolo dado a continuación es para sintetizar los aerogeles el uso de soluciones de fosfato 40 mM tamponadas de cyt. C que resulta en un cyt cargado. Concentración c en los aerogeles de 15 mM. </ P>
Como se describe, este procedimiento ha producido consistentemente cyt viable. C encapsulado dentro de los aerogeles. La concentración de cyt. C dentro de los aerogeles se puede variar desde 5 a 15 mM y de la concentración del tampón de la solución inicial c cyt. Encapsulado dentro de los aerogeles se pueden variar de 4,4 a 70 mM de fosfato sin graves efectos perjudiciales para la viabilidad de la proteína. Sin embargo, el centro del pico y la anchura del pico de la cyt característica. C Soret pico en aerogeles están más cerca de lo que son para el cit. C en solución cuando cit. C se encapsula en aerogeles de soluciones de tampón 40 mM 9.
La síntesis de la cyt. C SiO 2 aerogeles se ve afectado por la edad de algunos de los reactivos de partida. Metanol, tetrametoxisilano, y la solución de hidróxido de amonio son higroscópicas y deben ser reemplazados cada uno a dos meses. El aumento de agua que se acumula enestos reactivos con el tiempo afecta a las características estructurales de gel y el tiempo de transición sol-gel.
Cuando se realiza el secado supercrítico, barco de transporte del aparato de secado de punto crítico puede contener hasta dieciocho 0,5 cm de espesor, geles 1 cm de diámetro. Como se indica en la sección de protocolo, un relleno específico y procedimiento de drenaje se deben seguir para transferir dióxido de carbono en el método sol-gel. Es importante tener en cuenta que al comienzo del protocolo de drenaje, la mezcla de drenaje de dióxido de carbono y acetona fluye a una alta velocidad tal que el tubo de drenaje queda rígido con la humedad de condensación de hielo en el exterior. La mezcla se escape hacia afuera contiene un poco de agua ya que la acetona no es anhidro y esta agua de vez en cuando puede congelar en una medida que el tubo de drenaje se obstruye en realidad. Es necesario poner atención a tales obstrucciones y escuchar a un paro de flujo. La válvula de drenaje debe estar cerrada durante unos minutos por lo que la obstrucción se derretirá si se detecta una obstrucción. Enel peor de los casos, si la válvula de drenaje no está cerrado, una obstrucción puede causar tanto la presión se acumule que el tubo de drenaje aparece con fuerza fuera del aparato. Después de los primeros períodos de drenaje pocos, la mayoría de la acetona se habrá enjuagado fuera del aparato, y la aparición de trozos de hielo mojado disminuirá dramáticamente. La descarga se parecerá progresivamente hielo seco como el protocolo de drenaje continúa con cualquier evidencia residual de la presencia de acetona (por ejemplo, olor) convertirse en indetectables por el final del proceso de drenaje.
Después de que el dióxido de carbono en el aparato ha hecho la transición de líquido a fluido supercrítico y el proceso de ventilación ha comenzado, es necesario para liberar el fluido a una velocidad lenta durante al menos 45 min, como se indica en el procedimiento de 9. Una mayor tasa de liberación puede disminuir la viabilidad de cyt. C (como se muestra en la Figura 9) dentro de los aerogeles y los aerogeles sí mismos en realidad puede romperse como THe fluido se apresura a escapar de los geles. En general, incluso cuando los aerogeles permanecen intactos después de abrir la puerta de aparato, es importante para manejar con cuidado y suavemente, ya que son frágiles y pueden romperse fácilmente.
Los geles de sílice de control que se vierten junto con el cyt c. -SiO 2 geles se utilizan después del secado supercrítico para determinar si la transferencia de dióxido de carbono en los geles se realizó correctamente. A veces el cit. C SiO 2 geles pueden aparecer turbia y es importante para determinar si esto es debido a la transferencia incompleta disolvente o si pueden tener que ver con la concentración de la cit. C o tampón encapsulado dentro de los geles. Si C aparecer los geles de sílice sin cit. Tener un aspecto homogéneo, transparente en todo, esto puede ser tomado como evidencia de que la transferencia se produjo disolvente por completo, incluso si el cit. C-SiO2 geles tienen algo de turbidez a ellos. Nubosidad dentro de los geles de sílicesin cit. c después del secado indica que algo de acetona se mantuvo dentro de los geles durante la ventilación.
Como se indica en la sección de protocolo, importantes medidas de seguridad se deben tomar cuando se trabaja con el óxido nítrico (NO). Para detectar NO usando los aerogeles, es necesario para sellar la cubeta muy bien y de agotamiento de gas que fluye a lo largo de los aerogeles en una campana de humos. Por otra parte, todo el espectrofotómetro se puede mover en una campana de humos junto con el cilindro de gas NO como una precaución adicional para limitar la exposición al gas NO. En contacto con el aire NO producirá inmediatamente el dióxido de nitrógeno, tetróxido de nitrógeno altamente venenoso o ambos. NO también puede reaccionar con agua para producir vapores de calor y corrosivos. Por lo tanto, la exposición sostenida a NO puede producir toxicidad tisular directa.
Cuando se utiliza el cyt. C SiO 2 aerogeles para detectar la presencia de óxido nítrico, la banda Soret será inicialmente a ~ 408 nm y se desplazaráa ~ 414 nm en presencia de óxido nítrico. Después de cambiar de nuevo a nitrógeno, la banda Soret debe revertir de nuevo a estar centrado en ~ 408 nm. También puede ser posible utilizar el cyt. C SiO 2 aerogeles para detectar la presencia de otros ligandos tales como monóxido de carbono 27.
Diferentes procedimientos publicados incluyen un paso adicional de la combinación de las nanopartículas de oro o plata con cyt. C en solución antes de la mezcla con el sol y supercríticamente secado para formar aerogeles 4-8. La comparación de la espectroscopía UV-visible de cyt. C encapsulado en aerogeles con nanopartículas metálicas a la de cyt. C encapsulado en aerogeles sin nanopartículas de metal muestra que estos dos tipos de técnicas de encapsulación producen cyt. C de la viabilidad similares dentro de los aerogeles (Figura 5) . Sin embargo, el cyt. C encapsulada con nanopartículas de metal es ligeramente más estable que cyt. C encapsulard sin nanopartículas de metal en los aerogeles 9. Los espectros de CD de ambos tipos de cyt. Aerogeles c también son similares, aunque ambos se diferencian a partir del espectro de cyt. C en tampón que indica algún despliegue de cyt. C dentro de los aerogeles (Figura 7). Los informes anteriores sobre cyt. C encapsulados en aerogeles sugieren que la espectroscopia de dicroísmo circular es más probable evaluando la capa más externa de la proteína, desplegado al contacto con el gel de sílice, dentro de cualquiera de metal cyt de varias capas de nanopartículas nucleado. Estructuras c o estructuras poco organizadas que forman cuando no hay nanopartículas metálicas en aerogeles de 4,9. La mayoría de la cyt. C dentro de cualquier tipo de estructura auto-organizado dentro de los aerogeles permanece plegada tal como se mide por la espectroscopía UV-visible sin embargo. La ventaja del protocolo descrito en el presente documento nanopartículas sans es que compra cara o síntesis tiempo de metalesnanopartículas no es necesario. Las proteínas a menudo no se han encapsulado con éxito dentro de aerogeles, y por lo que este procedimiento es importante ya que puede conducir al desarrollo de un método más general para encapsular otras proteínas en aerogeles con importancia potencial para dispositivos bioanalíticos futuras.
The authors have nothing to disclose.
El apoyo a este trabajo y / o publicación fue proporcionado por el Instituto de Ciencias de la Facultad de Letras de la Universidad de Fairfield y Ciencias, Facultad de Becas de Investigación de la Universidad de Fairfield, un Premio Ciencia Cottrell Colegio de la Corporación de Investigación para la Ciencia Adelanto de la Facultad de Artes y Ciencias de la Universidad de Fairfield y Departamento de Química y Bioquímica de la Universidad de Fairfield. Agradecemos Jean Marie Wallace por visión mucho más útil y asesoramiento en lo que respecta a esta área de investigación general. Además, extendemos un agradecimiento muy especial a todos los pasados, actuales y futuros investigadores universitarios del laboratorio de investigación de Harper-Leatherman.
Potassium phosphate, monobasic | Fisher Scientific | P285-500 | Certified ACS (also possible to use sodium phosphate monobasic) |
Potassium phosphate dibasic anhydrous | Fisher Scientific | P288-500 | Certified ACS (also possible to use sodium phosphate dibasic) |
Water | Millipore Direct-Q | 18 MΩ cm | |
pH meter and electrode | Denver Instrument | UB-10 | |
Cytochrome c from equine heart | Sigma Aldrich | C7752-100MG | ≥95% based on Mol. Wt. 12,384, used as received and stored at -20°C |
Glass scintillation vials | Wheaton | 03-341-25J | 20 mL, O.D. x height (with cap): 28 mm x 61 mm |
Disposable cuvette | Fisher Scientific | 14-955-126 | methacrylate, 10 mm x 10 mm x 45 mm |
Ultraviolet Visible Spectrophotometer | Shimadzu | UV-1800 | Uses UVProbe v 2.33 software |
Circular dichroism spectrometer (or spectropolarimeter) | JASCO | J-810 | |
Isotemp Laboratory Refrigerator | Fisher Scientific | ||
Polypropylene disposable beakers | Fisher Scientific | 01-291-10 | 50 mL |
Tetramethylorthosilicate (also known as tetramethoxysilane, TMOS) | Sigma Aldrich | 218472-500G | 98% purity |
Methanol | Fisher Scientific | A457-4 | GC Resolv grade |
Ammonium hydroxide solution | Sigma Aldrich | 221228-25ML-A | ACS reagent, 28.0-30.0% |
General purpose polypropylene scintillation vials | Sigma Aldrich | Z376825-1PAK | 16 mm x 57 mm, volume size 6.5 mL, slice off bottom with sharp knife or razor |
generic plastic wrap | various | ||
Parafilm M laboratory wrapping film | Fisher Scientific | S37440 | |
Plastic syringe plunger | various | use syringe plunger from 3 mL syringe | |
Ethyl alcohol | Acros | 61509-0040 | Absolute, 200 proof, 99.5% A.C.S. reagent |
Acetone | Fisher Scientific | A949-4 | HPLC grade |
Critical point drying apparatus | Quorum Technologies | E3000 Series | |
Circulator | Fisher Scientific | Isotemp 3016 | |
Carbon dioxide cylinder | Tech Air | siphon tube | |
Micrometer | Central Tool Company | ||
GRAMS/AI 8.0 software | Thermo Electron Corporation | ||
Nitrogen cylinder | Tech Air | Another inert gas could be substituted | |
10% nitric oxide/90% nitrogen cylinder | Airgas | ||
Tygon tubing | various | ||
T-switch valve | various | ||
syringe needles | various |