Denne protokollen tar sikte på å kvantifisere SARS-CoV-2 RNA i avløpsvann og luftprøver som skal brukes til avløpsvannbaserte epidemiologiske studier og å vurdere eksponeringsrisikoen for SARS-CoV-2 i innendørs og utendørs aerosoler. Denne protokollen beskriver også en flislagt amplikon langmalsekvenseringstilnærming for SARS-CoV-2 helgenomkarakterisering.