Denne protokol har til formål at kvantificere SARS-CoV-2 RNA i spildevands- og luftprøver, der skal anvendes til spildevandsbaserede epidemiologiske undersøgelser, og at vurdere eksponeringsrisikoen for SARS-CoV-2 i indendørs og udendørs aerosoler. Denne protokol beskriver også en flisebelagt amplicon langskabelonsekventeringstilgang til SARS-CoV-2 helgenomkarakterisering.