Journal
/
Biochemie
/
Зондирование структуры РНК с мутационным профилированием диметилсульфата с секвенированием in vitro и в клетках
JoVE Journal
Biochemie
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemie
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Зондирование структуры РНК с мутационным профилированием диметилсульфата с секвенированием in vitro и в клетках

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

Kapitel

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Протокол содержит инструкцию по модификации РНК диметилсульфатом для экспериментов по мутационному профилированию. Он включает в себя зондирование in vitro и in vivo с двумя альтернативными методами подготовки библиотеки.

Tags

RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

Времяразрешенная ионизацией электрораспылением водорода дейтерий Обмен масс-спектрометрии для изучения белка структуры и динамики

Исследование последовательности протеинов-структуры-динамики Отношения с Bio3D-web

Полисома профилирование лейшманий, клетки человека и мыши яичка

Характеристика гликопротеины с складке иммуноглобулина рентгеноструктурного анализа и биофизических методов

Проверка структуры и динамики нуклеосом с помощью атомно-силовой микроскопии изображений

Сайт Направленный мутагенез для In Vitro и In Vivo экспериментов примером взаимодействия РНК в Escherichia Coli

Взаимодействие с и Мембрана Пермябилизация митохондрий мозга амилоида Фибрилс

Чрезвычайно быстрая и специфическая метаболическая маркировка РНК in Vivo с 4-Thiouracil (Ers4tU)

Быстрая и экономически эффективная РНК-экстракция крысиной ткани поджелудочной железы

Фосфопротеомная стратегия профилирования осмотического стресса Сигнализация в Арабидопсис

Read Article