Journal
/
Biochemie
/
Sondering af RNA-struktur med dimethylsulfatmutationsprofilering med sekventering in vitro og i celler
JoVE Journal
Biochemie
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemie
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells

Sondering af RNA-struktur med dimethylsulfatmutationsprofilering med sekventering in vitro og i celler

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

Kapitel

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Protokollen giver instruktion til modificering af RNA med dimethylsulfat til mutationsprofileringseksperimenter. Det omfatter in vitro og in vivo sondering med to alternative biblioteksforberedelsesmetoder.

Tags

RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

Time-løst elektrosprayioniserings Brint-deuterium Exchange-massespektrometri til at studere proteiners struktur og Dynamics

Undersøgelse Proteinsekvens-struktur-dynamik Forhold med Bio3D-web

Polysome profilering i Leishmania, menneskelige celler og mus Testis

Karakterisering af glykoproteiner med immunglobulin Fold af røntgenkrystallografi og biofysiske metoder

Sondering struktur og dynamik af Nucleosomes ved hjælp af Atomic Force mikroskopi Imaging

Site-Directed mutagenese for In Vitro og i Vivo eksperimenter eksemplificeret med RNA interaktioner i Escherichia Coli

Interaktioner med og membran Permeabilisering af hjernen mitochondrier af amyloid Fibrils

Ekstremt hurtig og specifik metabolisk mærkning af RNA in vivo med 4-thiouracil (Ers4tU)

Hurtig og omkostningseffektiv RNA udvinding af rotte pancreas væv

Fosforproteomic strategi for profilering osmotisk stress signalering i Arabidopsis

Read Article