यहां, हम बड़े पैमाने पर स्पेक्ट्रोमेट्री-आधारित प्रोटेओमिक्स द्वारा संक्रमण के दौरान मेजबान और रोगजनक के बीच परस्पर क्रिया को प्रोफाइल करने के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं। यह प्रोटोकॉल एक ही प्रयोग में दोनों मेजबान (जैसे, मैक्रोफेज) और रोगजनक (जैसे क्रिप्टोकसस नियोफॉर्मन)के प्रोटीन प्रचुरता में परिवर्तन को मापने के लिए लेबल-मुक्त मात्राकरण का उपयोग करता है।