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クロマチン免疫沈降とハイスループットシーケンシング(ChIP-seq)を用いたサルモネラバイオフィルムにおけるCsgD調節標的の発見
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January 18, 2020
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クロマチン免疫沈降と次世代シーケンシング(ChIP-seq)は、転写因子とそれらが制御するゲノム配列との間の相互作用を確立するために使用される方法です。このプロトコルは、例としてサルモネラ腸管セロバーチピムリウム細菌バイオフィルムを使用して、細菌バイオフィルムでChIP-seqを行うための技術を概説する。
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Palmer, M. B., Wang, Y., White, A. P. Discovering CsgD Regulatory Targets in Salmonella Biofilm Using Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-seq). J. Vis. Exp. (155), e60736, doi:10.3791/60736 (2020).
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