Nous présentons un protocole permettant de mesurer la consommation d’oxygène et l’acidification extracellulaire dans le cerveau larvaire et adulte de Drosophila melanogaster . Un analyseur métabolique est utilisé avec un protocole adapté et optimisé. Micro-tissu restrictions sont un élément essentiel du présent protocole et ont été conçues et créées spécialement pour leur utilisation dans cette analyse.