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Eine höchste Durchsatz mikrofluidischen Plattform für einzellige Genom-Sequenzierung
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An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
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Eine höchste Durchsatz mikrofluidischen Plattform für einzellige Genom-Sequenzierung

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10:00 min

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May 23, 2018

DOI:

10.3791/57598-v

DOI:
10.3791/57598-v

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10:00 min
May 23, 2018

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1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Summary

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Einzellige Sequenzierung zeigt genotypischen Heterogenität in biologischen Systemen, aber aktuelle Technologien fehlen des Durchsatzes für die Tiefe Profilierung der Zusammensetzung und Funktion notwendig. Hier beschreiben wir einen mikrofluidischen Workflow für die Sequenzierung > 50.000 einzellige Genome aus verschiedenen Zell-Populationen.

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Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

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Demaree, B., Weisgerber, D., Lan, F., Abate, A. R. An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing. J. Vis. Exp. (135), e57598, doi:10.3791/57598 (2018).

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