Generation of Genome-wide Chromatin Conformation Capture Libraries from Tightly Staged Early <em>Drosophila</em> Embryos

Clemens B. Hug; Juan M. Vaquerizas

doi:10.3791/57001

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Génération de chromatine Genome-wide Conformation Capture bibliothèques d’embryons de drosophile début étroitement mise en scène

JoVE Journal
Genetik

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Generation of Genome-wide Chromatin Conformation Capture Libraries from Tightly Staged Early Drosophila Embryos

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Génération de chromatine Genome-wide Conformation Capture bibliothèques d’embryons de drosophile début étroitement mise en scène

DOI:

10.3791/57001-v

•

10:35 min

•

October 03, 2018

•

Clemens B. Hug, Juan M. Vaquerizas

¹Max Planck Institute for Molecular Biomedicine

Kapitel

00:04Titel
00:37Embryo Fixation
01:48Embryo Sorting
03:07In Situ Hi-C – Lysis
04:57In Situ Hi-C – Digestion, Overhang Fill-in, and Ligation
06:58DNA Extraction
09:11Results: Analysis of Chromatin Conformation Capture Libraries from Drosophila Embryos
09:58Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Cet ouvrage décrit un protocole pour la génération de haute résolution en situ CIH bibliothèques d’étroitement mis en scène la gastrulation Drosophila melanogaster embryons.

Article

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ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Détermination de l'échelle du génome de Timing de réplication mammalienne par l'ADN Mesure Contenu

Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq

Capture promoteur Salut-c : Haute résolution, Genome-wide profilage des Interactions de promoteur

CRISPR induite par la réorganisation de la Structure de la chromatine boucle

Surveillance de Génome-large d’erreurs de Transcription dans les organismes eucaryotes

High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

Identification des contacts Enhancer-Promoteur dans les corps embryonnaires par capture quantitative de conformation des chromosomes (4C)

Analyse à l’échelle du génome de la distribution des modifications des histones à l’aide de la méthode de séquençage par immunoprécipitation de la chromatine dans Magnaporthe oryzae