Journal
/
Biochemie
/
Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering
JoVE Journal
Biochemie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Biochemie
Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering

DOI:
10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

, , , , , , ,
1St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Heilongjiang University of Chinese Medicine

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 01:00Preparation of Cells/Tissues
  • 01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
  • 04:45TMT Labeling of Peptides
  • 05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
  • 06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
  • 07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
  • 08:45Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Vi præsenterer en protokol for at nøjagtigt kvantificere proteiner med Isobar mærkning, omfattende fraktionering, bioinformatik værktøjer og kvalitetskontrol trin i kombination med væskekromatografi interface til en høj opløsning massespektrometer.

Tags

Keywords: Proteome ProfilingIsobaric LabelingLiquid ChromatographyMass SpectrometryQuantificationProtein IdentificationProtein QuantitationBiomarker DiscoveryCell LysisProtein DigestionAcetonitrileLys-C ProteaseDTTHEPES

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

check_url/de/56474?article_type=v

Sheathless kapillarelektroforese-massespektrometri for Metabolic profilering biologiske prøver
check_url/de/56474?article_type=v

Forbedret Prøve Multiplexing af væv under anvendelse kombinerede Precursor isotopmærkning og isobar Tagging (cPILOT)
check_url/de/56474?article_type=v

Time-løst elektrosprayioniserings Brint-deuterium Exchange-massespektrometri til at studere proteiners struktur og Dynamics
check_url/de/56474?article_type=v

Løsning affinitetsrensede proteinkomplekser ved Blå Native PAGE og protein Korrelation Profilering
check_url/de/56474?article_type=v

En Tandem væskekromatografi-massespektrometri-baseret tilgang til Metabolit Analyse af<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/de/56474?article_type=v

Proteom-wide kvantificering af mærkning homogenitet på enkelt-molekyle niveau
check_url/de/56474?article_type=v

Nitropeptid profilering og identifikation illustreret af angiotensin II
check_url/de/56474?article_type=v

Absolut kvantificering af celle frit protein syntese metabolisme ved omvendt fase-væskekromatografi-massespektrometri
check_url/de/56474?article_type=v

Label-fri Immunoprecipitation massespektrometri workflow for storstilet nuklear Interactome profilering
check_url/de/56474?article_type=v

Kvantitativ analyse af cellulære lipidom af Saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Read Article