Journal
/
Biochemie
/
High-resolution single particle analyse fra elektronkryo-mikroskopi billeder ved hjælp af SPHIRE
JoVE Journal
Biochemie
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemie
High-resolution Single Particle Analysis from Electron Cryo-microscopy Images Using SPHIRE

High-resolution single particle analyse fra elektronkryo-mikroskopi billeder ved hjælp af SPHIRE

DOI:
10.3791/55448-v

•

13:28 min

•

May 16, 2017

•

, , , , , , , ,
1Department of Structural Biochemistry,Max Planck Institute of Molecular Physiology, 2Department of Biochemistry and Molecular Biology,The University of Texas Medical School at Houston

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 01:16Micrograph Alignment and Particle Picking
  • 03:482D Classification and Initial 3D Modeling
  • 05:513D Model-refinement
  • 07:533D Sorting and Local Resolution Estimation
  • 10:46Results: High-resolution 3D Modeling of TcdA1
  • 12:19Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Dette papir præsenterer en protokol til behandling af cryo-EM-billeder ved hjælp af softwarepakken SPHIRE. Den nuværende protokol kan anvendes til næsten alle enkeltpartikel-EM-projekter, der er rettet mod nær-atomopløsning.

Tags

Keywords: Single Particle AnalysisElectron Cryo-microscopySPHIREMacromolecular ComplexesHigh-resolution Cryo-EMParticle Box SizeCTF EstimationMotion CorrectionDose-weightedDose-unweightedParticle Picking

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

check_url/de/55448?article_type=v

Semi-automatiske Biopanning af bakteriel Display biblioteker for peptid affinitet reagens opdagelse og analyse af resulterende isolater
check_url/de/55448?article_type=v

Proteinekspression og -oprensning af menneskelige Lipid-følsomme kation kanal TRPC3 for Strukturbestemmelse af enkelt-partikel kryo-elektronmikroskopi
check_url/de/55448?article_type=v

Complexome-profilering med høj opløsning ved Cryoslicing BN-MS-analyse
check_url/de/55448?article_type=v

Cryo-EM og enkeltpartikelanalyse med Scipion
check_url/de/55448?article_type=v

Forberedelse af lameller fra glasagtige biologiske prøver ved hjælp af et dobbeltstrålescanningselektronmikroskop til kryo-elektrontomografi
check_url/de/55448?article_type=v

Enkelt partikel kryo-elektronmikroskopi: Fra prøve til struktur
check_url/de/55448?article_type=v

Manuel blot-og-plunge frysning af biologiske prøver til enkelt-partikel kryogen elektronmikroskopi
check_url/de/55448?article_type=v

En robust arbejdsgang for behandling af kryo-elektronmikroskopi (cryo-EM) med cryoSPARC, RELION og Scipion
check_url/de/55448?article_type=v

Rutinemæssig indsamling af kryo-EM-datasæt i høj opløsning ved hjælp af 200 KV transmissionselektronmikroskop
check_url/de/55448?article_type=v

Fremme af højopløsningsbilleddannelse af virussamlinger i væske og is

Read Article