Summary

Menneskelig Pluripotente Stem Cell Based Udviklingstoksicitet Analyser for Kemisk Sikkerhed Screening og Systembiologi data Generation

Published: June 17, 2015
doi:

Summary

Protokollerne beskriver to in vitro udviklingsmæssige toksicitet testsystemer (UKK og UKN1) baseret på humane embryonale stamceller og transkriptom studier. Testsystemet forudser human udviklingsmæssige fare toksicitet, og kan bidrage til at reducere dyreforsøg, omkostninger og den tid, der kræves til kemisk sikkerhed test.

Abstract

Effektive protokoller til at differentiere humane pluripotente stamceller til forskellige væv i kombination med genomenbaserede teknologier åbnet nye horisonter til test in vitro toksicitet potentielle lægemidler. At skabe et solidt videnskabeligt grundlag for sådanne analyser, vil det være vigtigt at få kvantitative oplysninger om tidsforløbet for udvikling og om de underliggende reguleringsmekanismer ved systembiologiske metoder. To analyser er derfor blevet tunet her for disse krav. I UKK testsystem, er humane embryonale stamceller (hESC) (eller andre pluripotente celler) overladt til spontant at differentiere i 14 dage i embryoide organer til at tillade generering af celler fra alle tre kim lag. Dette system rekapitulerer vigtige trin af tidlig human embryonisk udvikling, og det kan forudsige humanspecifikke tidlig embryonal / teratogenicitet, hvis cellerne udsættes for kemikalier under differentiering. Den UKN1 testsystem er baseret på embryonale differentiere til en population af neuroektodermal progenitor (NEP) celler i 6 dage. Dette system rekapitulerer tidlig neural udvikling og forudser tidlig udviklingsneurotoksicitet og epigenetiske ændringer udløst af kemikalier. Begge systemer, i kombination med transkriptom microarray studier, er egnede til at identificere toksicitet biomarkører. Endvidere kan de anvendes i kombination til at generere input data for systemer biologi analyse. Disse testsystemer har fordele i forhold til de traditionelle toksikologiske undersøgelser kræver store mængder af dyr. De testsystemer kan bidrage til en reduktion af omkostningerne til lægemiddeludvikling og evaluering kemikaliesikkerhedsvurdering. Deres kombination belyser især på forbindelser, der kan påvirke nervesystemets udvikling specifikt.

Introduction

Evnen af humane embryonale stamceller (hESC) til at differentiere til forskellige typer af celler åbnet en ny æra af test in vitro toksicitet 1, sygdom modellering og regenerativ medicin 2. Stamcellerne er udstyret med evnen til at kopiere sig selv, for at holde deres pluripotente tilstand og til at differentiere til specialiserede celler 3,4. Egenskaberne af embryonale (kapacitet til at differentiere til alle større celletyper) findes også i andre humane pluripotente stamceller, såsom humane inducerede pluripotente stamceller (hiPSC) eller celler frembragt ved kernetransplantation 5. For eksempel har mange forskellige hESC linjer blevet differentieret til neuroner 6, nyreceller 7, neurale kamceller 8, cardiomyocytter 9-12 eller hepatocytter lignende celler 13,14. Desuden kan embryonale spontant differentiere til celler af alle tre kim lag 15-18 i embryoide legemer (EBS) 19,20. EArly fosterudvikling er reguleret af differentiel ekspression af forskellige gener relateret til de forskellige kim lag, der er blevet fanget på mRNA niveau ved transcriptomics hjælp microarray-teknologi 15. Disse bestræbelser har resulteret i etableringen af orgel særlige toksikologiske modeller baseret på embryonale / hiPSC og transcriptomics analyse (til gennemgang se 21,22). Disse modeller har fordele i forhold til traditionelle brug af forsøgsdyr til toksikologiske undersøgelser, som prækliniske studier anvender forsøgsdyr ikke altid kan forudsige menneskelig sikkerhed. Narkotika inducerede toksiciteter forekommer i patienter er ofte relateret til metaboliske eller signaleringsprocesser, der adskiller sig mellem mennesker og forsøgsdyr. Arten Forskellen har forhindret pålidelig tidlig påvisning af afkommet hos mennesker, og for eksempel lægemidler, såsom thalidomid 23,24 og diethylstilbestrol 25,26 blev trukket tilbage fra markedet på grund af teratogenicitet. ThaliDomide har ikke vist nogen udviklingstoksicitet hos rotter eller mus. Miljømæssige kemikalier såsom methylkviksølv 27 resulterede i prænatal udviklingstoksicitet i forhold til nervesystemet i forskellige arter, men menneskelige manifestationer have været svært at modellere i dyr. For at løse problemet med artsspecificitet spørgsmål, forskere, der arbejder under forskellige projekter baseret på stamceller som genbeskyt, ESNATS, kriminalassistent mv er engageret i udvikling af forskellige modeller for embryonale toksicitet, neurotoksicitet, kardiotoksicitet, hepatotoksicitet og nefrotoksicitet ved hjælp af humane giftstoffer mistænkes for at påvirker mennesker. Under det europæiske konsortium projektet "embryonale stamceller-baserede Novel Alternative Testing Strategies (ESNATS)" er blevet etableret fem testsystemer. Et testsystem den såkaldte UKK (U niversitäts k linikum K OLN) testsystem delvist fanger tidlig menneskelig fosterudvikling. I denne system humane embryonale H9 celler differentieres i tre kim lag (ectoderm, endoderm og mesoderm) 15 og kim lag specifikke underskrifter er blevet taget til fange af transcriptomics profil bruge Affymetrix microarray platform. Forskellige udviklingsmæssige giftstoffer som thalidomid 28, valproat, methyl kviksølv 16,17 eller cytosinarabinosid 15 er blevet testet i dette system, og der er opnået giftstof specifikt gen signaturer. I et andet testsystem, den såkaldte den UKN1 (U niversity K onsta n z) testsystem 1 er H9 celler differentieres til neuroectodermal stamceller (NEP) i 6 dage. Dette fremgår af høj ekspression af neurale genmarkører, såsom Pax6 og OTX2. Under differentiering i 6 dage, har NEP-celler været udsat for udviklingsmæssige neuro-giftstoffer, såsom VPA, methylkviksølv. Giftstof-specifikke deregulerede transcriptomics profiler har været obtained samt ved hjælp af Affymetrix microarray platform 16,29.

Den nye vision for toksikologi det 21. århundrede, forventes testsystemer ikke kun giver fænotypiske beskrivelser ligesom histopatologi in vivo, eller transkriptom ændringer i slutningen af langsigtede toksiske inkubationer. Det foreslår snarere, at analyser giver mekanistisk information 3, og at disse oplysninger kan kortlægges såkaldte negative udfald veje (AOP), der giver en videnskabelig begrundelse for farlige virkninger 30. At give sådanne oplysninger, testsystemet anvendte nødt til at være meget kvalitet kontrolleres 31, som for eksempel dokumenteret af robuste standard drift procedurer. Desuden skal kortlægges med høj opløsning tidsafhængig ændringer. Dette kræver testsystemer med synkroniserede ændringer 32. De UKN1 og UKK testsystemer beskrevet her er blevet optimeret til disse krav.

Protocol

Følgende protokol blev udført ved hjælp af humane embryonale stamceller line (embryonale) H9. Denne cellelinie var rutinemæssigt dyrket på mitotisk inaktiverede muse embryonale fibroblaster (MEF'er) i hESC kulturmedie suppleret med bFGF og derefter dyrket i stamceller medier på 6 cm Petri-plader overtrukket med basalmembran matrix, såsom matrigel, for at slippe af MEF. H9 celler fra> 80% sammenflydende plader blev anvendt til yderligere passage. H9-celler dyrket på basalmembran…

Representative Results

Methylkviksølv eksponering i UKK testsystem Cytotoksicitetsassayet blev udført med H9 EB'er at opnå en IC 10-værdi (reduktionen af levedygtighed med 10%) for cytotoksiciteten af methyl-kviksølv (figur 1). Vi udførte også en mikroarray baseret (Affymetrix platform) biomarkør undersøgelse. H9 EB'er har været udsat for methyl-kviksølv (0,25 og 1 uM) i 14 dage. På dag 14, er blevet indsamlet prøver ved anvendelse af TRIzol og RNA blev isoleret. Tr…

Discussion

Traditionelle tilgange til toksikologisk testning involverer omfattende dyreforsøg dermed gøre test dyrt og tidskrævende. Som følge af de interspecies forskelle de prækliniske sikkerhedsundersøgelser undersøgelser er ikke altid gyldige til at forudsige toksikologiske effekter potentielle lægemidler er relevante for mennesker. Selv ikke-menneskelige primater er mest forudsigelige, stadig stærk etisk og socioeconomical krav hurtigt hæve ved moderne samfund for at udvikle følsomme og robust in vitro tes…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

Referenzen

  1. Liu, W. W., Deng, Y. G., Liu, Y., Gong, W. R., Deng, W. B. Stem Cell Models for Drug Discovery and Toxicology Studies. Journal of Biochemical and Molecular Toxicology. 27 (1), 17-27 (2013).
  2. Zuba-Surma, E. K., Jozkowicz, A., Dulak, J. Stem Cells in Pharmaceutical Biotechnology. Current Pharmaceutical Biotechnology. 12 (11), 1760-1773 (2011).
  3. Leist, M., Hartung, T., Nicotera, P. The dawning of a new age of toxicology. ALTEX. 25 (2), 103-114 (2008).
  4. Kuegler, P. B., et al. Markers of murine embryonic and neural stem cells, neurons and astrocytes: reference points for developmental neurotoxicity testing. ALTEX. 27 (1), 17-42 (2010).
  5. Yamada, M., et al. Human oocytes reprogram adult somatic nuclei of a type 1 diabetic to diploid pluripotent stem cells. Nature. , (2014).
  6. Chambers, S. M., et al. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nature Biotechnology. 27 (3), 275-280 (2009).
  7. Takasato, M., et al. Directing human embryonic stem cell differentiation towards a renal lineage generates a self-organizing kidney. Nature cell biology. 16 (1), 118-126 (2014).
  8. Zimmer, B., et al. Evaluation of Developmental Toxicants and Signaling Pathways in a Functional Test Based on the Migration of Human Neural Crest Cells. Environmental Health Perspectives. 120 (8), 1116-1122 (2012).
  9. Bosman, A., et al. Molecular and Functional Evidence of HCN4 and Caveolin-3 Interaction During Cardiomyocyte Differentiation from Human Embryonic Stem Cells. Stem Cells and Development. 22 (11), 1717-1727 (2013).
  10. Sartiani, L., et al. Developmental changes in cardiomyocytes differentiated from human embryonic stem cells: A molecular and electrophysiological approach. Stem Cells. 25 (5), 1136-1144 (2007).
  11. Xu, X. Q., et al. Chemically defined medium supporting cardiomyocyte differentiation of human embryonic stem cells. Differentiation. 76 (9), 958-970 (2008).
  12. Pal, R., Mamidi, M. K., Das, A. K., Bhonde, R. Comparative analysis of cardiomyocyte differentiation from human embryonic stem cells under 3-D and 2-D culture conditions. Journal of Bioscience and Bioengineering. 115 (2), 200-206 (2013).
  13. Subramanian, K., et al. Spheroid Culture for Enhanced Differentiation of Human Embryonic Stem Cells to Hepatocyte-Like Cells. Stem Cells and Development. 23 (2), 124-131 (2014).
  14. Sivertsson, L., Synnergren, J., Jensen, J., Bjorquist, P., Ingelman-Sundberg, M. Hepatic Differentiation and Maturation of Human Embryonic Stem Cells Cultured in a Perfused Three-Dimensional Bioreactor. Stem Cells and Development. 22 (4), 581-594 (2013).
  15. Jagtap, S., et al. Cytosine arabinoside induces ectoderm and inhibits mesoderm expression in human embryonic stem cells during multilineage differentiation. British Journal of Pharmacology. 162 (8), 1743-1756 (2011).
  16. Krug, A. K., et al. Human embryonic stem cell-derived test systems for developmental neurotoxicity: a transcriptomics approach. Archives of Toxicology. 87 (1), 123-143 (2013).
  17. Leist, M., et al. Test systems of developmental toxicity: state-of-the art and future perspectives. Archives of Toxicology. 87 (12), 2037-2042 (2013).
  18. Itskovitz-Eldor, J., et al. Differentiation of human embryonic stem cells into embryoid bodies compromising the three embryonic germ layers. Molecular medicine. 6 (2), 88-95 (2000).
  19. Khoo, M. L. M., et al. Growth and differentiation of embryoid bodies derived from human embryonic stem cells: Effect of glucose and basic fibroblast growth factor. Biology of Reproduction. 73 (6), 1147-1156 (2005).
  20. Son, M. Y., Kim, H. J., Kim, M. J., Cho, S. Physical Passaging of Embryoid Bodies Generated from Human Pluripotent Stem Cells. Plos One. 6 (5), (2011).
  21. Winkler, J., Sotiriadou, I., Chen, S., Hescheler, J., Sachinidis, A. The potential of embryonic stem cells combined with -omics technologies as model systems for toxicology. Current medicinal chemistry. 16 (36), 4814-4827 (2009).
  22. Gunaseeli, I., Doss, M. X., Antzelevitch, C., Hescheler, J., Sachinidis, A. Induced pluripotent stem cells as a model for accelerated patient- and disease-specific drug discovery. Current medicinal chemistry. 17 (8), 759-766 (2010).
  23. Miller, M. T., Stromland, K. Teratogen update: Thalidomide: A review, with a focus on ocular findings and new potential uses. Teratology. 60 (5), 306-321 (1999).
  24. Newman, C. G. H. Teratogen Update – Clinical Aspects of Thalidomide Embryopathy – A Continuing Preoccupation. Teratology. 32 (1), 133-144 (1985).
  25. Stern, L. In vivo assessment of the teratogenic potential of drugs in humans. Obstetrics and gynecology. 58 (5 Suppl), 3S-8S (1981).
  26. Lynch, H. T., Reich, J. W. Diethylstilbestrol, Genetics, Teratogenesis, and Tumor Spectrum in Humans. Medical Hypotheses. 16 (3), 315-332 (1985).
  27. Satoh, H. Behavioral teratology of mercury and its compounds. Tohoku Journal of Experimental Medicine. 201 (1), 1-9 (2003).
  28. Meganathan, K., et al. Identification of Thalidomide-Specific Transcriptomics and Proteomics Signatures during Differentiation of Human Embryonic Stem Cells. Plos One. 7 (8), (2012).
  29. Balmer, N. V., et al. Epigenetic changes and disturbed neural development in a human embryonic stem cell-based model relating to the fetal valproate syndrome. Human Molecular Genetics. 21 (18), 4104-4114 (2012).
  30. Smirnova, L., Hogberg, H. T., Leist, M., Hartung, T. Developmental neurotoxicity – Challenges in the 21st Century and In Vitro Opportunities. ALTEX. 31 (2), 129-156 (2014).
  31. Leist, M., Efremova, L., Karreman, C. Food for thought … considerations and guidelines for basic test method descriptions in toxicology. ALTEX. 27 (4), 309-317 (2010).
  32. Zimmer, B., et al. Coordinated waves of gene expression during neuronal differentiation of embryonic stem cells as basis for novel approaches to developmental neurotoxicity testing. Cell Death and Differentiation. 18 (3), 383-395 (2011).
  33. Kraljevic, S., Stambrook, P. J., Pavelic, K. Accelerating drug discovery. EMBO Reports. 5 (9), 837-842 (2004).
check_url/de/52333?article_type=t

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

View Video