Summary

الإنسان الخلايا الجذعية المحفزة وبناء التنموي سمية فحوصات للسلامة الكيميائية الفحص وبيولوجيا الأنظمة توليد البيانات

Published: June 17, 2015
doi:

Summary

البروتوكولات تصف اثنين في المختبر نظم اختبار السمية التنموية (UKK وUKN1) بناء على الخلايا الجذعية الجنينية البشرية والدراسات Transcriptome على. نظم اختبار التنبؤ البشري الخطر سمية التنموي، ويمكن أن تسهم في الحد من الدراسات على الحيوانات والتكاليف والوقت اللازم لاختبار السلامة الكيميائية.

Abstract

بروتوكولات فعالة للتمييز الخلايا الجذعية المحفزة الإنسان إلى الأنسجة المختلفة في تركيبة مع فتحت التقنيات -omics آفاقا جديدة للفي التجارب المختبرية سمية الأدوية المحتملة. لتوفير أساس علمي متين لمثل هذه المقايسات، سيكون من المهم للحصول على معلومات كمية عن دوام التنمية وعلى الآليات التنظيمية الأساسية التي كتبها نهج بيولوجيا النظم. وهكذا تم ضبطها تحليلين هنا لهذه المتطلبات. في نظام اختبار UKK، وترك الخلايا الجذعية الجنينية البشرية (HESC) (أو الخلايا المحفزة الأخرى) للتمييز بشكل عفوي لمدة 14 يوما في الهيئات مضغي، للسماح توليد خلايا جميع الطبقات الجرثومية الثلاث. هذا النظام يلخص الخطوات الرئيسية في وقت مبكر من التطور الجنيني الإنسان، وأنه يمكن التنبؤ محددة البشري المبكر الجنينية / السمية المسخية، إذا تعرض الخلايا للمواد الكيميائية خلال التمايز. ويستند نظام اختبار UKN1 على HESC التفريق إلى populatأيون من الأديم الظاهر العصبي السلف (NEP) الخلايا لمدة 6 أيام. هذا النظام يلخص التطور العصبي في وقت مبكر ويتوقع العصابي المبكرة والتغييرات جينية الناجمة عن المواد الكيميائية. كلا النظامين، إلى جانب دراسات Transcriptome على ميكروأري، هي مناسبة لتحديد المؤشرات الحيوية سمية. وعلاوة على ذلك، فإنها يمكن أن تستخدم في تركيبة لتوليد إدخال البيانات لتحليل النظم البيولوجية. هذه النظم اختبار لديهم المزايا على دراسات السمية التقليدية التي تتطلب كميات كبيرة من الحيوانات. أنظمة الاختبار يمكن أن تسهم في الحد من تكاليف تطوير الأدوية وتقييم السلامة الكيميائية. الجمع بينهما يلقي الضوء بشكل خاص على المركبات التي يمكن أن تؤثر على النمو العصبي على وجه التحديد.

Introduction

قدرة الخلايا الجذعية الجنينية البشرية (HESC) على التمايز إلى أنواع مختلفة من الخلايا فتحت عهدا جديدا في المختبر سمية الاختبار والنمذجة المرض والطب التجديدي 2. وهبوا الخلايا الجذعية لديها القدرة على تكرار الذات، للحفاظ على دولتهم المحفزة، وعلى التمايز إلى خلايا متخصصة 3،4. خصائص HESC (القدرة على التفريق لجميع أنواع الخلايا الرئيسية) توجد أيضا في الخلايا المحفزة البشرية الأخرى الجذعية، مثل الخلايا الجذعية المحفزة التي يسببها الإنسان (hiPSC) أو الخلايا المولدة عن طريق التحويل النووي 5. على سبيل المثال، تم التفريق بين العديد من خطوط HESC مختلفة في الخلايا العصبية 6، 7 خلايا الكلى، وخلايا قمة العصبية 8، 12/09 العضلية، أو خلايا الكبد مثل الخلايا 13،14. وعلاوة على ذلك، يمكن HESC التفريق بصورة عفوية إلى خلايا كل الطبقات الجرثومية الثلاث 15-18 في الهيئات مضغي (EBS) 19،20. Eوينظم التطور الجنيني آرلي التي كتبها التعبير التفاضلية من الجينات المختلفة المتعلقة الطبقات الجرثومية المختلفة التي تم القاء القبض على مستوى مرنا من قبل transcriptomics باستخدام تكنولوجيا متطورة 15. وأسفرت هذه الجهود في إنشاء نماذج السمية أعضاء معينة على أساس HESC / hiPSC وتحليل transcriptomics (للمراجعة نرى 21،22). هذه النماذج لها مزايا أكثر من الاستخدام التقليدي للحيوانات المختبر لإجراء دراسات السمية، والدراسات قبل السريرية باستخدام الحيوانات المختبرية ليست دائما التنبؤية لسلامة الإنسان. والسميات المخدرات التي يسببها التي واجهتها في المرضى غالبا ما ترتبط عمليات الأيض أو الإشارات التي تختلف بين البشر وحيوانات التجارب. الفرق الأنواع قد حال دون الكشف موثوق في وقت مبكر من سمية النمو في البشر، والمخدرات سبيل المثال مثل الثاليدومايد 23،24 و 25،26 ثنائي إيثيل ستيلبوستيرول تم سحبها من السوق بسبب المسخية. ثاليلم يظهر domide أي سمية التنموية في الجرذان أو الفئران. أسفرت المواد الكيميائية البيئية مثل ميثيل الزئبق 27 في سمية النمو قبل الولادة مع الاحترام للجهاز العصبي في مختلف الأنواع، ولكن كانت مظاهر الإنسان من الصعب أن نموذج في الحيوانات. لمعالجة هذه المشكلة من القضايا خصوصية الأنواع، والعلماء الذين يعملون في إطار مشاريع مختلفة تعتمد على الخلايا الجذعية مثل ReProTect، ESNATS، DETECTIVE الخ منخرطون في تطوير نماذج مختلفة لسمية الجنينية، العصبية، عضلة القلب، الكبد وسمية كلوية استخدام المواد السامة الإنسان يشتبه في تؤثر على البشر. في إطار مشروع اتحاد الأوروبي 'الجنينية رواية استراتيجيات البديلة اختبار على الخلايا الجذعية (ESNATS)' وقد أنشئت خمسة أنظمة الاختبار. نظام واحد اختبار ما يسمى UKK (U niversitäts ك linikum K أعفرن) نظام اختبار يلتقط جزئيا في وقت مبكر التطور الجنيني الإنسان. في هذا يالييتم التمييز ystem خلايا H9 الجنينية البشرية في ثلاث طبقات جرثومية (أدمة، الأديم والأديم المتوسط) قد تم القبض على 15 والطبقة الجرثومية التوقيعات محددة transcriptomics ملف باستخدام منصة ميكروأري Affymetrix. وقد تم اختبار المواد السامة التنموية المختلفة مثل الثاليدومايد 28، حمض فالبرويك، ميثيل الزئبق 16،17، أو السيتوزين الأرابينوزيد 15 في هذا النظام، ولقد تم الحصول على مادة سامة محددة التوقيعات الجينات. في نظام الاختبار الثاني، ما يسمى (niversity U من K onsta ن ض) UKN1 نظام اختبار 1، تتمايز خلايا H9 إلى خلايا الأديم الظاهر العصبي السلف (NEP) لمدة 6 أيام. ويتضح ذلك من خلال التعبير عال من علامات الجينات العصبية مثل PAX6 وOTX2. وخلال التمايز لمدة 6 أيام، تعرضوا الخلايا السياسة الاقتصادية الجديدة لالتنموية العصبية المواد السامة مثل VPA، ميثيل الزئبق. كانت ملامح سمية محددة التنظيم دي transcriptomics obtaiنيد وكذلك باستخدام ميكروأري منصة Affymetrix 16،29.

رؤية جديدة لعلم السموم من القرن 21 تتوخى أن نظم اختبار لم تسفر ليس فقط الوصف المظهري مثل أمراض الأنسجة في الجسم الحي، أو التغييرات Transcriptome على في نهاية حضانات سمية على المدى الطويل. وتقترح بدلا من أن توفر فحوصات المعلومات الآلية وأن هذه المعلومات يمكن تعيينها إلى ما يسمى مسارات النتيجة السلبية (اوب) التي توفر المبرر العلمي لآثار خطرة 30. لتوفير مثل هذه المعلومات، وأنظمة الاختبار يطبق يجب أن تكون عالية الجودة للرقابة 31، وعلى سبيل المثال التي وثقتها إجراءات التشغيل القياسية قوية. وعلاوة على ذلك، تحتاج ليتم تعيينها مع ارتفاع القرار التغيرات المعتمدة على الزمن. وهذا يتطلب أنظمة الاختبار مع التغيرات متزامنة 32. وقد تم تحسين أنظمة الاختبار UKN1 وUKK هو موضح هنا لهذه المتطلبات.

Protocol

تم تنفيذ بروتوكول التالية باستخدام الجنينية البشرية خط الخلايا الجذعية (HESC) H9. وكان هذا الخط الخلية بشكل روتيني مثقف على الماوس المعطل ميتوتيكلي الخلايا الليفية الجنينية (MEFS) في وسائل الإعلام ثقافة HESC تستكمل مع bFGF ثم مثقف في وسائل…

Representative Results

التعرض للزئبق الميثيل في UKK نظام اختبار تم إجراء فحص السمية الخلوية مع H9 EBS للحصول على IC 10 قيمة (الحد من قابلية بنسبة 10٪) لسمية الخلايا من ميثيل الزئبق (الشكل 1). أجرينا أيضا (منصة affymetrix) دراسة العلامات البيولوجية ميكر?…

Discussion

الأساليب التقليدية لاختبار السمية وتشمل الدراسات على الحيوانات واسعة مما يجعل اختبار مكلفة وتستغرق وقتا طويلا. وعلاوة على ذلك، لوجود خلافات بين الأنواع الدراسات قبل السريرية سلامة الحيوانات غير صالحة دائما للتنبؤ تأثيرات سمية الأدوية المحتملة ذات الصلة للبشر. على…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

Referenzen

  1. Liu, W. W., Deng, Y. G., Liu, Y., Gong, W. R., Deng, W. B. Stem Cell Models for Drug Discovery and Toxicology Studies. Journal of Biochemical and Molecular Toxicology. 27 (1), 17-27 (2013).
  2. Zuba-Surma, E. K., Jozkowicz, A., Dulak, J. Stem Cells in Pharmaceutical Biotechnology. Current Pharmaceutical Biotechnology. 12 (11), 1760-1773 (2011).
  3. Leist, M., Hartung, T., Nicotera, P. The dawning of a new age of toxicology. ALTEX. 25 (2), 103-114 (2008).
  4. Kuegler, P. B., et al. Markers of murine embryonic and neural stem cells, neurons and astrocytes: reference points for developmental neurotoxicity testing. ALTEX. 27 (1), 17-42 (2010).
  5. Yamada, M., et al. Human oocytes reprogram adult somatic nuclei of a type 1 diabetic to diploid pluripotent stem cells. Nature. , (2014).
  6. Chambers, S. M., et al. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nature Biotechnology. 27 (3), 275-280 (2009).
  7. Takasato, M., et al. Directing human embryonic stem cell differentiation towards a renal lineage generates a self-organizing kidney. Nature cell biology. 16 (1), 118-126 (2014).
  8. Zimmer, B., et al. Evaluation of Developmental Toxicants and Signaling Pathways in a Functional Test Based on the Migration of Human Neural Crest Cells. Environmental Health Perspectives. 120 (8), 1116-1122 (2012).
  9. Bosman, A., et al. Molecular and Functional Evidence of HCN4 and Caveolin-3 Interaction During Cardiomyocyte Differentiation from Human Embryonic Stem Cells. Stem Cells and Development. 22 (11), 1717-1727 (2013).
  10. Sartiani, L., et al. Developmental changes in cardiomyocytes differentiated from human embryonic stem cells: A molecular and electrophysiological approach. Stem Cells. 25 (5), 1136-1144 (2007).
  11. Xu, X. Q., et al. Chemically defined medium supporting cardiomyocyte differentiation of human embryonic stem cells. Differentiation. 76 (9), 958-970 (2008).
  12. Pal, R., Mamidi, M. K., Das, A. K., Bhonde, R. Comparative analysis of cardiomyocyte differentiation from human embryonic stem cells under 3-D and 2-D culture conditions. Journal of Bioscience and Bioengineering. 115 (2), 200-206 (2013).
  13. Subramanian, K., et al. Spheroid Culture for Enhanced Differentiation of Human Embryonic Stem Cells to Hepatocyte-Like Cells. Stem Cells and Development. 23 (2), 124-131 (2014).
  14. Sivertsson, L., Synnergren, J., Jensen, J., Bjorquist, P., Ingelman-Sundberg, M. Hepatic Differentiation and Maturation of Human Embryonic Stem Cells Cultured in a Perfused Three-Dimensional Bioreactor. Stem Cells and Development. 22 (4), 581-594 (2013).
  15. Jagtap, S., et al. Cytosine arabinoside induces ectoderm and inhibits mesoderm expression in human embryonic stem cells during multilineage differentiation. British Journal of Pharmacology. 162 (8), 1743-1756 (2011).
  16. Krug, A. K., et al. Human embryonic stem cell-derived test systems for developmental neurotoxicity: a transcriptomics approach. Archives of Toxicology. 87 (1), 123-143 (2013).
  17. Leist, M., et al. Test systems of developmental toxicity: state-of-the art and future perspectives. Archives of Toxicology. 87 (12), 2037-2042 (2013).
  18. Itskovitz-Eldor, J., et al. Differentiation of human embryonic stem cells into embryoid bodies compromising the three embryonic germ layers. Molecular medicine. 6 (2), 88-95 (2000).
  19. Khoo, M. L. M., et al. Growth and differentiation of embryoid bodies derived from human embryonic stem cells: Effect of glucose and basic fibroblast growth factor. Biology of Reproduction. 73 (6), 1147-1156 (2005).
  20. Son, M. Y., Kim, H. J., Kim, M. J., Cho, S. Physical Passaging of Embryoid Bodies Generated from Human Pluripotent Stem Cells. Plos One. 6 (5), (2011).
  21. Winkler, J., Sotiriadou, I., Chen, S., Hescheler, J., Sachinidis, A. The potential of embryonic stem cells combined with -omics technologies as model systems for toxicology. Current medicinal chemistry. 16 (36), 4814-4827 (2009).
  22. Gunaseeli, I., Doss, M. X., Antzelevitch, C., Hescheler, J., Sachinidis, A. Induced pluripotent stem cells as a model for accelerated patient- and disease-specific drug discovery. Current medicinal chemistry. 17 (8), 759-766 (2010).
  23. Miller, M. T., Stromland, K. Teratogen update: Thalidomide: A review, with a focus on ocular findings and new potential uses. Teratology. 60 (5), 306-321 (1999).
  24. Newman, C. G. H. Teratogen Update – Clinical Aspects of Thalidomide Embryopathy – A Continuing Preoccupation. Teratology. 32 (1), 133-144 (1985).
  25. Stern, L. In vivo assessment of the teratogenic potential of drugs in humans. Obstetrics and gynecology. 58 (5 Suppl), 3S-8S (1981).
  26. Lynch, H. T., Reich, J. W. Diethylstilbestrol, Genetics, Teratogenesis, and Tumor Spectrum in Humans. Medical Hypotheses. 16 (3), 315-332 (1985).
  27. Satoh, H. Behavioral teratology of mercury and its compounds. Tohoku Journal of Experimental Medicine. 201 (1), 1-9 (2003).
  28. Meganathan, K., et al. Identification of Thalidomide-Specific Transcriptomics and Proteomics Signatures during Differentiation of Human Embryonic Stem Cells. Plos One. 7 (8), (2012).
  29. Balmer, N. V., et al. Epigenetic changes and disturbed neural development in a human embryonic stem cell-based model relating to the fetal valproate syndrome. Human Molecular Genetics. 21 (18), 4104-4114 (2012).
  30. Smirnova, L., Hogberg, H. T., Leist, M., Hartung, T. Developmental neurotoxicity – Challenges in the 21st Century and In Vitro Opportunities. ALTEX. 31 (2), 129-156 (2014).
  31. Leist, M., Efremova, L., Karreman, C. Food for thought … considerations and guidelines for basic test method descriptions in toxicology. ALTEX. 27 (4), 309-317 (2010).
  32. Zimmer, B., et al. Coordinated waves of gene expression during neuronal differentiation of embryonic stem cells as basis for novel approaches to developmental neurotoxicity testing. Cell Death and Differentiation. 18 (3), 383-395 (2011).
  33. Kraljevic, S., Stambrook, P. J., Pavelic, K. Accelerating drug discovery. EMBO Reports. 5 (9), 837-842 (2004).
check_url/de/52333?article_type=t

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

View Video