Mekik hücre tipine spesifik protein yerelleştirme ve Nükleositoplazmik karakterizasyonu için esnek ve verimli bir yöntem açıklanmıştır. Bu heterokaryon yaklaşım görüntü protein lokalizasyonu hücre füzyonu sonra floresan etiketli füzyon proteinleri kullanır. Protokol kararlı durum lokalizasyonu veya canlı hücre görüntüleme dayalı daha dinamik tespitler mükellef.
Önemli bir sayıda proteinler, hücre içi ticareti veya nucleocytolasmic mekik tarafından düzenlenir. Bu proteinler, RNA ve protein nükleer ithalat / ihracat, transkripsiyonal yönetmelik, ve apoptosis gibi hücresel fonksiyonları çeşitli bir dizi gösterir. İlginçtir, hücre bölünmesi, farklılaşma ve dönüşüm de dahil olmak üzere önemli hücresel yeniden yapılanma, sık sık bu tür faaliyetler 3,4,8,10 içerir. Bu proteinlerin ve kendi düzenleyici mekanizmaların detaylı bir çalışma bu lokalizasyon değişiklikleri zor olabilir uyarılması ve kendilerini izlemek için oldukça dinamik ve zor olabilir hareketleri gibi zor olabilir. Hücresel karsinojeneze içeren çalışmalar, örneğin, anlayış yollar ve birincil, normal hücreleri ve transforme hücreleri 6,7,11,12 arasında farklılık protein aktiviteleri yararlanmaya devam. Birçok protein değişmiş dönüşümü sırasında veya lokalizasyonu, dönüşümün bir sonucu olarak verimli bir şekilde bu proteinlerin karakterize etmek için yöntemler ve ilaç hedef karsinojeneze ve açık yeni alanlar anlayışı geliştirmek stand katıldığı yollar gösterir.
Burada protein ticareti analizi için bir yöntem mevcut ve birincil ve transforme memeli hücreleri arasındaki aktivite mekik. Bu yöntem, kararlı durum ya da dinamik protein lokalizasyonu tespit etmek için kullanılan esnek bir protokol sağlamak için floresan mikroskobu ile heterokaryon füzyonlar nesil birleştirir. Şekil 1'de gösterildiği gibi, iki ayrı hücre tipleri geçici ilgi gen bağlı bir Fluoroprotein geni taşıyan plazmid yapıları ile transfekte. Ifade sonra, hücreler polietilen glikol kullanarak erimiş ve protein lokalizasyonu daha sonra çeşitli yöntemler kullanarak görüntülü olabilir. Burada sunulan protokol, özel teknikler ilave edilebilir temel bir yaklaşımdır.
Burada sunulan heterokaryon protokol hücre tipine spesifik lokalizasyon davranış yanı sıra Nükleositoplazmik mekik faaliyet karakterizasyonu için etkin ve kolay yorumlanabilir bir yöntem sağlar. Bu yöntem, floresan analizi duyarlılık yanı sıra yetenek görüntü canlı hücreleri ve protein dinamiği çalışmaları gerçekleştirmek yararlanır. Tekniği, pek çok farklı hücre tipleri için kolayca adapte ve hem canlı ve sabit hücre görüntüleme için uygun. Örneğin, ters floresan mikroskopi canlı görüntüleme ve zaman atlamalı video yakalama için kullanılabilir. Buna karşılık, kararlı durum lokalizasyonu veya ayrık lokalizasyonları daha ayrıntılı konfokal görüntüleme belirlenmesi için iki Epifloresans mikroskopi monte hücreleri kullanılıyor olabilir. Ayrıca, bu tür photobleaching sonra floresan kurtarma (sıkı bağlamak), ya da floresan photobleaching içinde kaybı (FLIP) gibi teknikler, lokalizasyon kinetiği 1 tespitinde kullanılabilir . Protokol alternatif fluorophores birleşme 2 konser yapılacak floresan rezonans enerji transferi (FRET) gibi protein etkileşim deneyler için izin verecek. Leptomycin B veya olumsuz egemen olarak hücresel ticareti Çeşitli inhibitörleri Ran GTPaz yapıları, özellikle ithalat veya ihracat yollar 5,6,9 bağımlılığı kurmak için kullanılabilir .
The authors have nothing to disclose.
Worcester Politeknik Enstitüsü Bölümü Kimya ve Biyokimya finansman için teşekkür etmek istiyorum.
Material Name | Typ | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
Effectene reagent | Qiagen | 301425 | ||
Phosphate buffered saline (PBS) | Sigma-Aldrich | P5493 | ||
Trypsin | Fisher | SH3023602 | ||
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Fisher | SH30243FS | High glucose | |
paraformaldehyde | FisherChemical | O4042-500 | ||
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Sigma-Aldrich | D9542-10MG | ||
Hyclone Serum (fetal bovine) | Thermo Scientific | SH3008803HI | ||
Falcon 6-well plates | Fisher | 08-772-1B | ||
Polyethylene glycol 1000 | Fisher | 528875-25GM | ||
Cover slips | Fisher | 12-545-85 | ||
DABCO | Sigma-Aldrich | D2522-25G | ||
Nucleofector HDF kit | Lonza | VPD-1001 |