A Nanopore-Based Genomic Approach to Control Rabies in Low-Income Countries

August 18, 2023

Sequencing van het hele genoom voor snelle karakterisering van het rabiësvirus met behulp van nanoporietechnologie

02:47 min
•

Monstervoorbereiding, RNA-extractie, PCR-opschoning en kwantificering voor sequencing van het hele genoom van het rabiësvirus (RABV)

03:08 min
•

Sequencing, live en offline basecalling, analyse en interpretatie van het genoom van het rabiësvirus (RABV)

05:00 min
•
, , , , , , , , ,
1School of Biodiversity, One Health & Veterinary Medicine,University of Glasgow, 2Research Institute for Tropical Medicine, 3University of Nairobi, Institute of Tropical and Infectious Diseases, 4Tanzania Industrial Research Development Organization, 5Ifakara Health Institute, 6MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research, 7Department of Veterinary Public health,Ahmadu Bello University, 8African Centre of Excellence for Neglected Tropical Diseases and Forensic Biotechnology,Ahmadu Bello University, 9University of Nairobi, Kenya and Center for Epidemiological Modelling and Analysis,University of Nairobi

Summary

Automatische Übersetzung

Hier presenteren we een snelle en kosteneffectieve workflow voor het karakteriseren van genomen van het rabiësvirus (RABV) met behulp van nanoporietechnologie. De workflow is bedoeld om genomics-geïnformeerde surveillance op lokaal niveau te ondersteunen, door informatie te verstrekken over circulerende RABV-lijnen en hun plaatsing binnen regionale fylogenieën om rabiësbestrijdingsmaatregelen te begeleiden.

Article