Journal
/
生物学
/
Dekryptere høyoppløselig 3D-kromatinorganisasjon via Capture Hi-C
JoVE 杂志
生物学
This content is Free Access.
JoVE 杂志 生物学
Deciphering High-Resolution 3D Chromatin Organization via Capture Hi-C

Dekryptere høyoppløselig 3D-kromatinorganisasjon via Capture Hi-C

DOI:
10.3791/64166-v

•

09:32 min

•

October 14, 2022

•

, , , , , , ,
1EMBL: European Molecular Biology Laboratory, 2Institut Curie, 3Agilent Technologies, 4Genmab BV, 5Collège de France

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:53Formaldehyde Fixation
  • 07:54Results: Capture Hi-C, 5C, and Hi-C Interaction Maps across the 3 Mb and 1 Mb Captured Region
  • 09:05Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Denne protokollen beskriver Capture Hi-C-metoden som brukes til å karakterisere 3D-organisasjonen av megabaserte målrettede genomiske regioner ved høy oppløsning, inkludert grenser for topologisk assosierende domener (TAD) og langdistansekromatininteraksjoner mellom regulatoriske og andre DNA-sekvenselementer.

Tags

Keywords: Capture Hi-CHigh-resolution3D Chromatin OrganizationGenome TopologyGene RegulationChromatin LandscapeCell TypesModel SystemsCell CountingCell FixationCell Suspension

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

check_url/cn/64166?article_type=v

High-resolution Measurement of Odor-Driven Behavior in Drosophila Larvae
check_url/cn/64166?article_type=v

Neuronal Cell Cultures from Aplysia for High-Resolution Imaging of Growth Cones
check_url/cn/64166?article_type=v

High-Resolution Video Tracking of Locomotion in Adult Drosophila Melanogaster
check_url/cn/64166?article_type=v

Zebrafish Whole Mount High-Resolution Double Fluorescent In Situ Hybridization
check_url/cn/64166?article_type=v

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.
check_url/cn/64166?article_type=v

Kombinert Immunofluorescence og DNA FISH på 3D bevarte Interphase Nuclei å studere endringer i 3D Nuclear Organization
check_url/cn/64166?article_type=v

Rask og effektiv Sebrafisk Genotyping Bruke PCR med høy oppløsning Melt Analysis
check_url/cn/64166?article_type=v

Isolering av Spesifikke Genomiske Regioner og Identifisering av Associated Molekyler av enChIP
check_url/cn/64166?article_type=v

En High Resolution metode for å overvåke Fosforylering avhengig Aktivering av IRF3
check_url/cn/64166?article_type=v

Høy oppløsning Optisk Kartlegging av Mouse sinoatrielt Node

Read Article