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Decifrare l'organizzazione della cromatina 3D ad alta risoluzione tramite Capture Hi-C
JoVE 杂志
生物学
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JoVE 杂志 生物学
Deciphering High-Resolution 3D Chromatin Organization via Capture Hi-C
DOI:

09:32 min

October 14, 2022

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Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:53Formaldehyde Fixation
  • 07:54Results: Capture Hi-C, 5C, and Hi-C Interaction Maps across the 3 Mb and 1 Mb Captured Region
  • 09:05Conclusion

Summary

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Questo protocollo descrive il metodo Capture Hi-C utilizzato per caratterizzare l'organizzazione 3D di regioni genomiche mirate di dimensioni megabased ad alta risoluzione, compresi i confini dei domini topologicamente associati (TAD) e le interazioni cromatiniche a lungo raggio tra elementi regolatori e altri elementi di sequenza del DNA.

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