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Entschlüsselung der hochauflösenden 3D-Chromatinorganisation über Capture Hi-C
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生物学
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JoVE 杂志 生物学
Deciphering High-Resolution 3D Chromatin Organization via Capture Hi-C
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Entschlüsselung der hochauflösenden 3D-Chromatinorganisation über Capture Hi-C

DOI:
10.3791/64166-v

•

09:32 min

•

October 14, 2022

•

, , , , , , ,
1EMBL: European Molecular Biology Laboratory, 2Institut Curie, 3Agilent Technologies, 4Genmab BV, 5Collège de France

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:53Formaldehyde Fixation
  • 07:54Results: Capture Hi-C, 5C, and Hi-C Interaction Maps across the 3 Mb and 1 Mb Captured Region
  • 09:05Conclusion

Summary

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Dieses Protokoll beschreibt die Capture Hi-C-Methode, die verwendet wird, um die 3D-Organisation von megabasierten Zielgenomregionen mit hoher Auflösung zu charakterisieren, einschließlich der Grenzen topologisch assoziierender Domänen (TADs) und langreichweitiger Chromatininteraktionen zwischen regulatorischen und anderen DNA-Sequenzelementen.

Tags

Keywords: Capture Hi-CHigh-resolution3D Chromatin OrganizationGenome TopologyGene RegulationChromatin LandscapeCell TypesModel SystemsCell CountingCell FixationCell Suspension

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