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Déchiffrer l’organisation de la chromatine 3D haute résolution via Capture Hi-C
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JoVE 杂志 生物学
Deciphering High-Resolution 3D Chromatin Organization via Capture Hi-C
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Déchiffrer l’organisation de la chromatine 3D haute résolution via Capture Hi-C

DOI:
10.3791/64166-v

•

09:32 min

•

October 14, 2022

•

, , , , , , ,
1EMBL: European Molecular Biology Laboratory, 2Institut Curie, 3Agilent Technologies, 4Genmab BV, 5Collège de France

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:53Formaldehyde Fixation
  • 07:54Results: Capture Hi-C, 5C, and Hi-C Interaction Maps across the 3 Mb and 1 Mb Captured Region
  • 09:05Conclusion

Summary

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Ce protocole décrit la méthode Capture Hi-C utilisée pour caractériser l’organisation 3D de régions génomiques ciblées de taille mégamétrique à haute résolution, y compris les limites des domaines topologiquement associés (TAD) et les interactions chromatines à longue distance entre les éléments de séquence d’ADN régulateurs et autres.

Tags

Keywords: Capture Hi-CHigh-resolution3D Chromatin OrganizationGenome TopologyGene RegulationChromatin LandscapeCell TypesModel SystemsCell CountingCell FixationCell Suspension

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