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通过捕获Hi-C 破 译高分辨率3D染色质组织
JoVE 杂志
生物学
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JoVE 杂志 生物学
Deciphering High-Resolution 3D Chromatin Organization via Capture Hi-C
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通过捕获Hi-C 破 译高分辨率3D染色质组织

DOI:
10.3791/64166-v

•

09:32 min

•

October 14, 2022

•

, , , , , , ,
1EMBL: European Molecular Biology Laboratory, 2Institut Curie, 3Agilent Technologies, 4Genmab BV, 5Collège de France

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:53Formaldehyde Fixation
  • 07:54Results: Capture Hi-C, 5C, and Hi-C Interaction Maps across the 3 Mb and 1 Mb Captured Region
  • 09:05Conclusion

Summary

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该协议描述了用于以高分辨率表征超大型靶基因组区域的3D组织的Capture Hi-C方法，包括拓扑关联结构域（TAD）的边界以及调控和其他DNA序列元件之间的长程染色质相互作用。

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Keywords: Capture Hi-CHigh-resolution3D Chromatin OrganizationGenome TopologyGene RegulationChromatin LandscapeCell TypesModel SystemsCell CountingCell FixationCell Suspension

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