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मैग्नापोर्टे ओरिज़ा में क्रोमेटिन इम्यूनोप्रिपिटेशन अनुक्रमण पद्धति का उपयोग करके हिस्टोन संशोधनों के जीनोम-वाइड विश्लेषण
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遗传学
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JoVE 杂志 遗传学
Genome-wide Analysis of Histone Modifications Distribution using the Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method in Magnaporthe oryzae
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मैग्नापोर्टे ओरिज़ा में क्रोमेटिन इम्यूनोप्रिपिटेशन अनुक्रमण पद्धति का उपयोग करके हिस्टोन संशोधनों के जीनोम-वाइड विश्लेषण

DOI:
10.3791/62423-v

•

09:25 min

•

June 02, 2021

•

, , , , , ,
1Beijing Key Laboratory of New Technology in Agricultural Application, National Demonstration Center for Experimental Plant Production Education, Department of Agronomy,Beijing University of Agriculture

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:39Preparation of Protoplasts from M. oryzae
  • 01:48In Vivo Crosslinking and Sonication
  • 03:22IP of Crosslinked Protein/DNA
  • 04:23Collecting and Rinsing the IP Products
  • 05:04Elution and Reverse Crosslinking of Protein/DNA Complexes
  • 05:56Purification and Recovery of DNA
  • 06:51DNA Repair and Solexa Library Construction
  • 08:23Results: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method for Genome-wide Histone Modification Analysi
  • 08:53Conclusion

Summary

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यहां, हम हिस्टोन संशोधनों के जीनोम-व्यापी वितरण का विश्लेषण करने के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं, जो एम ओरिज़ी और अन्य फिलामेंटस कवक के रोगजनन में नए लक्ष्य जीन की पहचान कर सकता है।

Tags

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)Histone ModificationsMagnaporthe OryzaeEpigenetic RegulationFungal PathogenesisGenome-wide AnalysisTranscription FactorsDNA-protein InteractionsProtoplast PreparationSonicationAgarose Gel Electrophoresis

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