Journal
/
遗传学
/
Analyse à l’échelle du génome de la distribution des modifications des histones à l’aide de la méthode de séquençage par immunoprécipitation de la chromatine dans Magnaporthe oryzae
JoVE 杂志
遗传学
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 遗传学
Genome-wide Analysis of Histone Modifications Distribution using the Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method in Magnaporthe oryzae
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Analyse à l’échelle du génome de la distribution des modifications des histones à l’aide de la méthode de séquençage par immunoprécipitation de la chromatine dans Magnaporthe oryzae

DOI:
10.3791/62423-v

•

09:25 min

•

June 02, 2021

•

, , , , , ,
1Beijing Key Laboratory of New Technology in Agricultural Application, National Demonstration Center for Experimental Plant Production Education, Department of Agronomy,Beijing University of Agriculture

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:39Preparation of Protoplasts from M. oryzae
  • 01:48In Vivo Crosslinking and Sonication
  • 03:22IP of Crosslinked Protein/DNA
  • 04:23Collecting and Rinsing the IP Products
  • 05:04Elution and Reverse Crosslinking of Protein/DNA Complexes
  • 05:56Purification and Recovery of DNA
  • 06:51DNA Repair and Solexa Library Construction
  • 08:23Results: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method for Genome-wide Histone Modification Analysi
  • 08:53Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Ici, nous présentons un protocole pour analyser la distribution à l’échelle du génome des modifications des histones, qui peut identifier de nouveaux gènes cibles dans la pathogenèse de M. oryzae et d’autres champignons filamenteux.

Tags

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)Histone ModificationsMagnaporthe OryzaeEpigenetic RegulationFungal PathogenesisGenome-wide AnalysisTranscription FactorsDNA-protein InteractionsProtoplast PreparationSonicationAgarose Gel Electrophoresis

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

Détermination de l'échelle du génome de Timing de réplication mammalienne par l'ADN Mesure Contenu

Analyse du promoteur du ligand c-KIT utilisant l'immunoprécipitation de la chromatine

Immunoprécipitation à la chromatine (ChIP) dans les lignes de cellules T de souris

Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

Chromatine protocole d’immunoprécipitation (puce) pour les échantillons embryonnaires de faible abondance

Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq

Génération de chromatine Genome-wide Conformation Capture bibliothèques d’embryons de drosophile début étroitement mise en scène

Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) des Modifications d’Histone de Saccharomyces cerevisiae

Capture promoteur Salut-c : Haute résolution, Genome-wide profilage des Interactions de promoteur

Immunoprécipitation de la chromatine du murin tissu adipeux brun

Read Article