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大規模な空間スケールでバイオフィルムの形態形成を解明する自動化された3D光コヘレンス断層撮影
6,746 Views
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00:09 min
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August 21, 2019
DOI:
1Stream Biofilm and Ecosystem Research Laboratory, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 2Plateforme technique, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 3Water Chemistry and Water Technology, Engler-Bunte-Institut,Karlsruhe Institute of Technology, 4Thorlabs GmbH
Summary
Automatically generated
微生物バイオフィルムは、相間で複雑なアーキテクチャを形成し、高度にスケール依存する空間パターンに発展します。ここでは、3D光コヘレンス断層撮影(OCT)データセットの自動取得のための実験システム(ハードおよびソフトウェア)を紹介する。このツールセットは、空間と時間におけるバイオフィルム形態形成の非侵襲的かつ多スケールの特性を可能にする。
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3D Optical Coherence TomographyBiofilm MorphogenesisAutomated SystemLarge Spatial ScalesExtended Time PeriodsEcosystem ProcessesNatural SystemsEngineered EnvironmentsPrecision Positioning DevicePlexiglass FlumeGRBL ServerMicrofluidic DevicesFlow ChambersFlumesFiltration SystemsOCT SystemImage AcquisitionPositioning DeviceDovetail HolderImmersion Adapter
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Depetris, A., Wiedmer, A., Wagner, M., Schäfer, S., Battin, T. J., Peter, H. Automated 3D Optical Coherence Tomography to Elucidate Biofilm Morphogenesis Over Large Spatial Scales. J. Vis. Exp. (150), e59356, doi:10.3791/59356 (2019).
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