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Chapters
- 00:04Title
- 01:24Preparation of S or M Phase-arrested Cells
- 02:19Formaldehyde Cross-linking
- 04:49Immunoprecipitation
- 07:32Results: Capturing and Analyzing PKR-interacting RNAs During the Cell Cycle Using qRT-PCR
- 08:45Conclusion
Nous présentons des approches expérimentales pour étudier RNA-Interactiens de bicaténaire RNA binding protéine kinase activée par RNA (PKR) durant le cycle cellulaire chez les mammifères, à l’aide de cellules HeLa. Cette méthode utilise le formaldéhyde pour crosslink RNA-PKR complexes et immunoprécipitation pour enrichir PKR lié aux ARN. Ces ARN peut être davantage analysé par séquençage haut-débit ou qRT-PCR.
Tags
RNA InteractorsProtein Kinase RNA-ActivatedMammalian Cell CycleCrosslinkingFormaldehydeImmunoprecipitationNeurodegenerative DiseaseParkinson’s DiseaseAlzheimer’s DiseaseDouble-stranded RNARNA-binding ProteinsPost-transcriptional RegulationGene ExpressionCell Cycle ArrestHeLa CellsThymidineNocodazole
