Journal
/
遗传学
/
Пробоподготовки и анализа данных на основе RNASeq ген выражение данио рерио
JoVE 杂志
遗传学
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 遗传学
Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Пробоподготовки и анализа данных на основе RNASeq ген выражение данио рерио

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Этот протокол представляет собой подход для анализа всей транскриптом от zebrafish эмбриона, личинки, или сортировка клеток. Мы включать изоляции РНК, путь анализа данных RNASeq и на основе ПЦР qRT Проверка изменения выражения гена.

Tags

RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA Sequencing发育生物学Comparative Analysis

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

Параллельное измерение циркадных часов экспрессии генов и гормональную секрецией человека первичных клеточных культур

Одноклеточный экспрессии генов профилирование с помощью FACS и КПЦР с внутренними стандартами

Изучение экспрессии генов, регулируемых клеточным циклом, двумя протоколами синхронизации комплементарных ячеек

Двунаправленная ретровирусная интеграция сайта Методология ПЦР и количественный анализ данных

Измеряя экспрессии генов в бомбардировке ячменя Aleurone слои с повышенной пропускной способностью

Метод Optogenetic для контроля и анализа картин выражения гена в ячейке для взаимодействия

Экдистероидов рецепторов на основе единственного гена переключатель за преднамеренное выражение трансген с надежностью, обратимость и незначительной утечки

Изучения корня микрофлора: извлечение данных бактериальных сообщества из почвы, ризосфере и корень Endosphere

Информатики анализ последовательности данных из пакетного дрожжи 2-гибрид экраны

Сохранение биологических культур и измерения экспрессии генов в nerii тля: Non модель системы для взаимодействия растений насекомое

Read Article