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Hochauflösende Einzelteilchenanalyse aus Elektronen-Kryomikroskopie-Bildern mit SPHIRE
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生物化学
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JoVE 杂志 生物化学
High-resolution Single Particle Analysis from Electron Cryo-microscopy Images Using SPHIRE
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Hochauflösende Einzelteilchenanalyse aus Elektronen-Kryomikroskopie-Bildern mit SPHIRE

DOI:
10.3791/55448-v

•

13:28 min

•

May 16, 2017

•

, , , , , , , ,
1Department of Structural Biochemistry,Max Planck Institute of Molecular Physiology, 2Department of Biochemistry and Molecular Biology,The University of Texas Medical School at Houston

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:16Micrograph Alignment and Particle Picking
  • 03:482D Classification and Initial 3D Modeling
  • 05:513D Model-refinement
  • 07:533D Sorting and Local Resolution Estimation
  • 10:46Results: High-resolution 3D Modeling of TcdA1
  • 12:19Conclusion

Summary

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Dieses Papier stellt ein Protokoll für die Verarbeitung von Kryo-EM-Bildern mit der Software-Suite SPHIRE vor. Das vorliegende Protokoll kann für fast alle Einzelteilchen-EM-Projekte angewendet werden, die auf eine nahezu atomare Auflösung abzielen.

Tags

Single Particle AnalysisElectron Cryo-microscopySPHIREMacromolecular ComplexesHigh-resolution Cryo-EMParticle Box SizeCTF EstimationMotion CorrectionDose-weightedDose-unweightedParticle Picking

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