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환자 조직에 대한 메틸 결합 DNA 캡처 시퀀싱
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JoVE 杂志 遗传学
Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues
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환자 조직에 대한 메틸 결합 DNA 캡처 시퀀싱

DOI:
10.3791/54131-v

•

08:40 min

•

October 31, 2016

•

, , , , , , ,
1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:18Methyl-binding DNA Capture
  • 02:10Single Fraction Elution
  • 03:08Ethanol Precipitation
  • 04:29Sequencing
  • 05:58Results: Sequencing of Methyl-binding DNA Capture
  • 07:15Conclusion

Summary

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여기서 우리는 프로토콜이 메틸 바인딩 DNA 캡처 시퀀싱 (MBDCap-서열 또는 MBD-SEQ) 기술과 이후의 생물 정보학 분석 파이프 라인을 사용하여 대규모 임상 환자 스크리닝 연구에서 게놈 전체 DNA 메틸화를 조사하기 위해 제시한다.

Tags

DNA MethylationEpigeneticsPatient CohortsBiomarkersMethyl-binding DNA CaptureSequencingGenome-wide AnalysisCost-effectiveSonicationFragment SizeElutionMagnetic Beads

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